OpenChrom软件使用介绍6_Process处理过程使用
前面说过OpenChrom是一款用于色谱，质谱，光谱等数据处理开源软件。可以处理不同仪器厂家的数据格式，支持通用格式。可以用于不同的电脑操作系统，例如Windows，macOS，Linux。前面介绍了初步使用的流程和方法，核对质谱结果，文件检索，保留指数计算及校对，Amdis解卷积应用。本篇介绍Process处理过程使用。
在第一篇介绍了GCMS数据处理的基本流程，即下面的三部曲。
调用GCMS数据文件，参见前面第一篇文章。
峰检出，在色谱上面右键点击，Peak Detector>First Derivative。
峰积分，在色谱图上面右键点击，选Peak integrator>Peak Integrator Trapezoid。
峰鉴定，在色谱图上面右键点击，选Peak Identifier> NIST(extern)或Library File（MS）。
参见前面第一或第三篇文章。
这样的方式处理数据，需要至少3步的操作来完成。如果加上峰过滤，就还需增加一个操作步骤。本篇介绍处理过程方法，把几个处理操作整合在一起，一次完成。
1. 创建process method处理过程方法
使用前也要对Preference，个性化设置进行相应的设置。
1.1在Processors菜单打开Create Process Method
图1 打开Create Process Method
1.2 选择要处理的数据类别
选择数据类别，例如光谱，不同色谱检测器的数据。对于GCMS数据，选择MSD (quadrupole, IonTrap, …)，Finish。
图2 选择要处理数据类别
图3 Process Method
把文件改一下，例如PM_test，Save。注意Process Method处理过程方法的文件名后缀为ocm。
图4 处理过程方法
点击右上栏下面的绿色加号，Add a process method添加一个处理过程方法。
图5 处理过程方法
首先添加峰检出方法。注意处理过程方法设置的次序必须是峰检出，峰积分，峰检索。Setting设置，Process Entry，在Category。选择Peak Detector。
图6 选择处理方法
在Process选择First Detective
图7 选择峰检出方式
Finish
图8 选择峰检出方式
Finish，可以看到峰检出的方法已经加入到第一行。
图9 添加峰检出方式
同样方法添加积分器。
图10 添加峰积分器
图11 添加峰积分器
同意方法，来添加峰检索
图12 添加峰检索
图13 添加峰检索
同理，如果使用峰过滤Peak Filter（按要求过滤部分不需要的峰）。
图14 添加峰过滤
最后，点击*PM_test.ocm[MSD]，OK，保存process method处理过程方法。
图15 退出并保存
2. 使用process method处理过程方法
点击右上方的Show the method toolbar工具按钮。
图16 方法按钮
在第二行可以看到method工具栏。
图17 方法工具栏
图18 选择方法路径
点击选择方法目录Select the method directory
图19 选择方法路径
Select Folder。
调用方法：在方法工具栏前面选择前面建立的处理过程方法PM_test.ocm。
图20 选择处理过程方法
点击绿色箭头，加载处理过程方法。
图21 加载处理过程方法
处理过程方法在运行。
图22 处理过程方法运行
过一会后（处理时间取决于数据大小和电脑快慢），就可以看到经过峰检出，峰积分和峰检索的结果了。
图23 峰检出，峰积分和峰检索结果
图24 Peak/Scan List
这样处理GCMS数据更为快捷省事。
第六部分完。
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