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【第三届原创参赛】手把手教你如何在API Analyst软件中创建个性化报告模板

小猪飞飞

2010/08/04

私聊

液质联用（LCMS）

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仪器信息网第三届原创大赛参赛作品-

手把手教你如何在API Analyst软件中创建个性化报告模板

在液质联用仪器的常规样品分析中，耗费精力较多的工作是最初的液相、质谱条件的优化和确立，但做任何事都要善始善终，因此，结尾即输出报告也显得相当重要。从这几年用到过的几大软件，主要有Empower、Masslynx、Analyst、Chemstation，各有千秋、各有特色。总的来说Empower功能较为强大，但操作较为复杂，其中也有不少功能是多数人用不到的。Masslynx做得比较漂亮，很直观，功能也比较强大。Chemstation是公认的比较容易上手的软件。Analyst1.5的可视性不是特别好，不够直观，但是用起来还比较顺手。最近还用了个岛津的GPCGCMS，随机带的操作光盘倒是做得非常棒，基本上跟着视频边做边学，很快就会上手。下面主要谈谈如何利用Analyst软件创建自己的模板。

一、结果表格中条目的编辑

言归正传，今天主要谈最近用得较多的Analyst软件。Analyst中自带的模板较多，大概20多个，但不一定能满足我们的工作需要。最近因为模板，老是请教工程师帮忙做，后来不太好意思总是让工程师改来改去，自己就研究了一下。现将体会分享给大家。

如下图所示，是大家非常熟悉的Analyst1.5版本的登陆界面。API的软件有个好处就是安装时不用输序列号，不用担心key的丢失，因此每次登陆都要点下Register later。

如题，跳过样品优化及分析过程，直接进入样品的数据分析过程。在定量方法建好、并将数据批量分析好后会得到如下图所示的一个表格。

这个表格每次都会以默认的条目打开，因此有时就显得不太方便。举几个例子，默认是将sample ID放在里面，但事实上很少用得到；默认是将峰面积以及峰高等显示为科学计数法，看起来不太方便。又如，默认不显示峰的名称，这样看起来很不方便。但是可以进行适当的修改，如下图所示，在表中任意处右键，在出现的快捷方式中依次选择table settings->Edit->column->done，会弹出一个对话框（如下图），在这里，可以对表格中所有条目的显示与否以及格式进行修改。

在上图中的下拉菜单中是分析物、样品、内标等等所对应的条目，表格中共五列，从左到右依次是条目的名称、显示与否、有效数字与否、科学技术法与否、数字位数，其中，如果勾选了有效数字、没有选择科学技术法，precision中的数字的意思就是有效数字的位数，如果前两者都没有选，则precision中表示的是小数的位数，还有其他的情况，版友们可以自己去尝试。另外，在这当中还比较常用的，就是把分析物的名称以及信噪比条目显示出来。

在这里要提下，每个用户按照自己习惯的设定方式改动之后，可以将其保存，以便下次处理数据时直接套用这样的格式。方法是在表格任意处右键，快捷菜单中选择table settings->Export To New Table Settings。这时会弹出一个对话框，要你为新的表格格式输入一个名字，如api。

下次处理数据后，可通过在表格任意处右键，快捷菜单中选择table settings->api，这样就能按照自己需要的表格格式来显示结果了。

附件：

手把手教你如何在API Analyst软件中创建个性化模板.pdf

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小猪飞飞

第1楼2010/08/04

二、报告模板及report3.0.1版本的安装

先看看1.5版本上自带的1.0的Report，在上述结果表的窗口上端的tools的下拉菜单中选择report，在弹出的对话框中选择所需要的模板（这里选择默认的sample report 1模板），直接ok即可生成报告。如下图所示。

但从图中可以看出，有的项目所显示的信息较为多余，有的信息显示不正确。如峰面积，即使我在软件的结果表格中已经将显示方式改为非科学计数法，但此处仍然显示的是科学计数法。这时就需要修改模板，以便符合出具报告的需要。

Report 1.0中修改模板的方法是依次点击：开始->所有程序->Applied Biosystems MDS Sciex->Analyst Report->Creat or edit Templets。如下图所示

点开之后出现一个对话框，上面的选项卡分别是编辑已有模板、创建新的模板。点击sample report 1，将以word形式打开这个模板，可以发现这个模板上有向语言一样的内容，如图中的a. Aera就是表示分析物质的峰面积。如图中右边所示，模板中会出现report专用的模板编辑工具条。所有的编辑就是通过这个工具条进行。如图，中，选中模板中，然后选择工具条中Content Tags，这时会弹出一个对话框，在其中可以对的属性进行修改。如图中对话框中Number Format后显示的是0.00,这就表示模板中的保留时间将保留两位小数，如果需要三位，就在此处输入0.000，即可。

Report 1.0的模板总的来说不是那么直观，改变某个值的属性要在一堆符号中选择。现在官方网站上已经有3.01版本的了。下面就阐述下如何通过3.01版本的report来修改自己想要的模板。软件下载地址http://www.absciex.com/Downloads/Software-Downloads
找到Reporter 3.0.1，上述的链接包含了两个安装程序（另一个尚未使用到），下载后解压缩选择setup，如图所示

安装开始时会问你要安装2003及以上的版本的word，这个版本的report已经支持到2007版的word，但鉴于大多数人还是使用的2003版word，下面按2003版描述。有的电脑（xp sp2）会提示要安装sp3，需要下载安装SP3。

安装完之后，在Analyst中的导航菜单的最下方，会出现report 3.01的栏目。如下图

首先打开模板。如果report 3.01是默认路径安装，则按照下图的路径打开文件夹Templates，并选择其中名称为sample report 1 的模板。

打开sample report 1后可以发现这个模板与老版本的模板有了一些微小的差别。

注意：编辑模板之前，要么将这个模板另存为一个文件，要么把默认的所有模板进行备份，以防覆盖。另外，3.01版本模板的后缀是.xml，而1.0版本的后缀是.dot，这两个版本不兼容，似乎不太好直接转变，两者之间还有个2.0版本（在此不做累述）。

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第2楼2010/08/04

三、编辑模板

下面就开始编辑模板。

（一）xml架构的调用

首先要使得模板处于可编辑的状态。点击word菜单栏：工具->模板和加载项，出现对话框

选择第二个选项卡XML架构，选择添加架构，在弹出的对话框中选择C:\Program Files\Applied Biosystems MDS Sciex\Reporter\Resources\ ASciexWordReporterSchema.xsd

打开后，在弹出的对话框中输入任意一个别名，此处输入xml

确定后如下图所示，注意：要将xml或者你命名的架构前打上勾，再确定。

添加架构之后，就可以对模板进行编辑了。可以看到模板已经多了很多粉红色的标记，而这些标记正是用来编辑所对应条目属性，与1.0版本相比，编辑界面更为直观。

在某一红色区域右键，快捷菜单中选择查看XML结构

屏幕的右边会出现XML的结构图，其中的每一个元素都对应于表格中的某一个粉红色区域。点击时光标会移动到对应的位置。

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第3楼2010/08/04

（二）几个实例操作

（1）去掉不必要的信息

首先是去掉一些不要的信息，这个很简单，只要选中对应的单元格，剪切即可，如去掉图中黑色选中的部分

剪切之后在做略微调整，得到如下图所示的效果

（2）增加文字及数值

第二个操作是在上图data file下面加入一个同样的data file。方法有几种，一种是直接复制某条目。

另一种是在对应的单元格内右键->应用XML元素->TField，

再在该单元格红色区域内右键选择属性。

或者在右边的XML架构图中选择相应的XML元素，单击选属性，这会在架构图中的这个TField 之前会有显示“此标记的某些属性无效”的标记，直接选属性。

会得到如下的属性编辑对话框，其中有三项。一般会用到Name和format。

选中Name，在下拉菜单中选择Sample File Name，点击添加

这样，Name就进入到下面的属性中。

在对话框中打开一个处理过的数据结果表

双击导航菜单中的report 3.0.1

产生选择模板的对话框

选择之前编辑过的模板（之前我已将模板另存为example），点击生成报告。如图所示，添加的Data File与模板原有的格式内容均一致。其他的添加文字内容的都可以如法炮制，用TField这个元素完成。

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第4楼2010/08/04

（3）改变峰面积的显示格式

下面对峰面积的数字显示格式进行修改。选中峰面积值的红色区域，右键选择属性，出现如下对话框。可以看到当前模板中峰面积的默认格式，即Format的值是0.000e+00，这是科学记数法，0的个数是显示的数字位数。其它选项还有非科学计数法，如0（表示的是显示为整数）、0.0（显示一位小数），以此类推……在选定为新的格式后，要点一下右上角的“修改”，再确定。如果直接点确定，显示的还是原来的值。如果需要直接显示出Analyst结果表中的值（有关结果表中如何显示所需要格式的值，见上述阐述内容），有两种方法。一种是下图中Format值另一个选择项“none”，第二种方法是将Format这一条目直接删除，只留下Name一个条目。

（4）改变图谱的显示格式

下面看下图谱格式的修改，如修改图的放大与缩小。下图是按照报告模板生成的报告，默认方式是将图谱放大，显得峰特别宽，不是很好看。

同样是在模板图谱区域的红色处右键选择属性，具体的选择设定方法，板油们可以自己体会，在此不做赘述。改变后的结果如下图，这样就好看多了。

（5）其他

给出一个修改后的模板所生成的报告，可以看到图中有些内容已经不是默认格式。包括下面还增加了一条标准曲线。

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小猪飞飞

第6楼2010/08/04

总之，修改这个模板看似复杂，其实不是很难，主要是要知道如何添加一个xml架构，如何查看xml架构，以及理解架构属性中赋值的含义。当然，还要熟悉Analyst软件中结果表格属性的设定。基本上看了以上的叙述后，会对如何运用Analyst 1.5出具报告有了一定的认识。由于篇幅较长，有些内容还未放在其中，但都可以触类旁通。如果以上内容有不正确之处还请各位版友指正，如果还有不清楚的问题或者有与模板相关的问题，也请板油们积极提问、探讨，共勉！