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【第三届原创参赛】分析数据脱机处理串烧

数据处理

  • 参加原创大赛的:

    前言

    这次我不写实验了,做点纸上谈兵的东西。由于各种软件多种多样,我只能对我比较熟悉的如热电的Ominic(红外)、XcalibarGC-MS)、安捷伦的ChemStation气相-液相)、PEWinlab原吸ICP)、岛津的UVProbe(紫外)、戴安的变色龙(离子色谱),还有些接触过的如耐驰的TG/DSC、麦克的比表面吸附、布鲁克的核磁等。各种仪器的各种软件处理各个仪器出来的数据,按照说明书照着作就行了,为什么要去脱机处理呢?通常有以下几种情形:

    1. 写文章需要:写文章的经常需要添加谱图,而分析报告中谱图直接帖在文章里不好看或说明不了问题,需要进行修改。

    2. 外送测试自行处理:只能拿到数据或纸质报告,接触不到仪器操作者。比如前一阵我们这里外送做核磁,人家说只做不解释,联系人怯生生的跟我说没给图,就e-mail了一堆数据,我说这个最好,比图更容易看。

    3. 不同仪器之间数据的比较:不同公司的软件做出的原始数据有特定的格式,不能通用,不同版本有时也不能互通。

    4. 同一类型仪器互相交流数据和方法:比如我们不同部门的同一型号仪器,同样方法懒得重新设置,直接复制过来就行。

    5. 还有一种情况,客户的能力很强或者警惕性很高,只要分析人员做操作工即可。比如我们这搞催化剂的人都很牛,做TGBET,都是要了数据文件自己用Origin去处理研究的。
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  • wanttofly

    第1楼2010/11/23

    一.通用办法:

    电子版报告通吃办法:本来我觉得这个大家都知道,不用写的。但是经常看到人家问某某软件如何导出图片或如何转成pdf文件,因此觉得还是应该写一点,以示完整。

    1.1 Pdf文件:安装一个pdf打印机,只要你的软件能够打印,就可以把报告转成pdf文件,我一般用来保存电子数据结果和给其他人发送电子结果。这个是我常用的一个pdf打印机程序。(程序不让传,网上有下载的,fppPro220)

    1.2图片:当然和1.1一样,你可以安装图片格式打印机。还有个简单的办法,在你电脑上调整好你要的图片,按键盘上的Printscreen键,打开画图板或其它图片处理软件,粘贴切割和保存。这个用于对默认报告格式不满意又不想修改的偷懒着最适用。

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  • wanttofly

    第2楼2010/11/23

    二、几种软件和处理办法

    2.1软件的几种类型:

    2.1.1. 可以脱机安装,脱机处理,可以打开多种格式的数据(包括其它公司的),可以导出多种格式的数据,如Ominic。还有是公用处理的软件,NIST

    2.1.2. 可以脱机安装,脱机处理,只能打开本软件的格式数据,可以复制本软件的数据格式和导出数据文件,只要安装盘不带加密的软件基本都可以做到,如XcalibarChemStation

    2.1.3. 不能脱机安装和使用,不能打开其它数据,只能导出数据文件,就是安装需要软件狗的那些软件,比如戴安的变色龙。


    2.2处理办法:

    2.2.1:12两种软件可进行脱机安装,然后来处理测定的数据,第二种只能处理同型号仪器的数据,第一种还可以用来处理其它任何兼容的仪器得到的数据。至于处理方法,就跟联机的软件操作一样。对于如GC-MS三维图,测试人是无法给出所有谱图的报告的,我们有个课题组长很钻研,跟我借了Xcalibar自己安装了,以后我只要给他.raw的文件,他就可以自己处理了。

    2.2.2:对于所有这些软件都可以导出数据文件,如TXT、CSV、DIF等ASCII码格式,根据软件不同用另存为或EXPORT得到数据文件,然后用数据处理软件,如originExcel来处理。
    omnic:save as下面选项

    安捷伦化学工作站输出

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  • wanttofly

    第3楼2010/11/23

    三.应用举例说明
    3.1 EPA下载的谱图导入红外数据库:
    在EPA网站上有很多气体红外谱图,可以下载为.spc的文件,我将它下载到我的电脑中,在文件类型中选择所有文件,打开图并进行各种处理。图为我将一个NO的红外图(从图的信息中可以看出测定条件浓度等)存到红外数据库中,以后可以自由的查看检索了。

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  • wanttofly

    第4楼2010/11/23

    3.2 单独使用NIST处理质谱数据
    关于使用NIST的方法坛子里也有介绍,我这里想说的是NIST其实是可以单独安装使用的,并非一定要放在仪器自带的软件上。我的是热电的仪器带的NIST,但可以打开其它公司的原始数据进行分析。
    方法:安装了NIST以后,在程序中选择AMDIS Analysis,从打开的下拉菜单中看到几乎所有的质谱厂商都有了,但是我没那么多数据来测试,只知道热电、安捷伦的都可以打开

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  • wanttofly

    第5楼2010/11/23

    3.3 一个外送核磁样品自己推导结构
    这是一个高分子做的氢谱,给我了数据,我没有核磁软件,是用origin画图算的积分,硬着头皮纸上谈兵推出来是聚邻/对苯二甲酸丁二醇酯。由于做图选择坐标问题,和核磁软件出来的谱图是相反的
    结论:本来是word,为大家看起来方便,我用图片打印机将其专成JPG格式
    原始数据:

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  • qiuxingwei

    第6楼2010/11/25

    很多软件在保存的 时候可以存为CSV的格式,就是EXECL格式的原始数据。可以自己作图等等。

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  • dahua1981

    第7楼2010/11/25

    应助达人

    楼主总结的很好,希望能够获奖

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  • wanttofly

    第8楼2010/11/25

    谢谢大家,csv是数据格式的一种,我将这部分内容细化了一点,要写的其实很多,但又怕太罗嗦,没重点。

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  • 社区=冬季=

    第9楼2010/12/02

    好像没有最后的结论

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  • zj2635

    第10楼2010/12/05

    楼主的文章言简意赅,使我受益匪浅,但其中一些软件还未使用过,所以,只能回头再好好琢磨。感谢分享!

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