省部重点实验室
第1楼2010/12/03
四、大肠杆菌质粒DNA的提取(碱裂解法)
此方法适用于小量质粒DNA的提取提取的质粒DNA可直接用于酶切PCR扩增。
1. 取1.5ml细菌培养物于EP管中,4000rpm离心1分钟,弃上清液,使细菌沉淀尽量干燥;
2. 将细菌沉淀重悬于用冰预冷的100 μl溶液I (50 mmol/L葡萄糖,10 mmol/L EDTA pH 8.0,25 mmol/L Tris-HCl pH 8.0) 中,剧烈振荡;
3. 加入200 μl新配制的溶液II(0.2 mol/L NaOH,1%SDS(m/v)),盖紧EP管口,快速颠倒离心管5次,以混合混合物,确保离心管的整个内表面与溶液II接触,不要涡旋,置于冰浴中;
4. 加入150 μl预冷溶液III(每100 ml 的溶液III中含60 ml 5 mol/L 乙酸钾,11.5 ml冰乙酸,28.5 ml H2O),盖紧EP管口,反复颠倒数次,使溶液III在粘稠的细菌裂解物中分散均匀,之后将管置于冰上3~5分钟;
5. 在最大转速下离心5min,取上清液于另一新EP管;
6. 用两倍体积的乙醇室温沉淀双链DNA,振荡混合于室温放置2分钟,最大转速离心5分钟;
7. 小心吸去上清液,将离心管倒置于滤纸上,以使所有液体都流出,在将附于管壁的液滴除尽;
8. 加1ml 70%乙醇洗涤沉淀,振荡混合,用12,000g离心2分钟,弃上清,将开口的EP管置于室温使乙醇挥发,直至EP管中内没有可见的液体存在(5~10分钟),用适量的ddH2O溶解;
9. 用0.5μl的RNase 37℃温育5~10分钟;
10. 电泳鉴定。
五、感受态细胞的制备
1. 挑取适当菌株的E.coli 单菌落接种于2ml SOB培养液中,37℃摇床过夜。
2. 取0.5-1ml过夜培养的菌液转种到50ml SOB中,18℃剧烈震荡,直到A600达到0.6。
3. 将培养物转移到50ml离心管中,4℃ 4,000rpm/min离心10min。同时在冰浴上配置TB溶液。
4. 弃上清,将离心管倒置于滤纸上,使培养液被吸干。
5. 取1ml刚配的TB溶液打散菌体沉淀,再加入15ml TB(1/3体积的起始培养液),冰浴10-15min,4℃ 4,000rpm/min离心10min。
6. 弃上清,沉淀重悬于4ml TB(1/12.5体积的起始培养液),冰浴10min。
7. 加入280μl DMSO,缓缓滴入并轻轻摇晃,使其充分混合均匀,冰浴10min。
8. 将菌液分装于EP管中,-80℃或液氮冻存。
9. 取两管感受态细胞分别加入1μl无菌ddH2O(阴性对照)和1μl纯质粒(阳性对照)进行转化(见后),以检测感受态的质量。阴性对照平板上应该无菌落生长,阳性对照平板上菌落数目的多少显示感受态效率的高低。
六、SOB的配制:
蛋白胨 20g
酵母提取物 5g
NaCl 0.58g
KCl 0.186g
100×Mg++溶液 10ml
溶解并加水定容至1L,121℃×20min高压蒸汽灭菌
100×Mg++溶液:
MgCl2﹒6H2O
MgSO4﹒7H2O
溶解并加水定容至100ml,121℃×20min高压蒸汽灭菌
TB溶液的配制:
1M KCl 5ml
0.55M MnCl2 2ml
0.5M CaCl2 0.6ml
0.1M K-Pipes(pH 6.7) 2ml
ddH2O 10.4ml
Total 20ml
注:上述溶液均需高压蒸汽灭菌处理
0.1M K-Pipes(pH=6.7)的配制:
称取3.02g Pipes粉末溶于80ml dd H2O中,此时粉末不能完全溶解,用10N KOH或KOH固体调节PH值,只有当PH接近6.7时粉末才能完全溶解,此时当小心少量地加入KOH直至达到所需PH值。
七、转 化
1. 取100μl感受态细胞于冰浴上融化。
2. 加入1μl纯质粒或连接产物,轻轻吹打混匀,冰浴30 min。
3. 将菌液放入42℃水浴中热激90秒,立即放入冰浴中2 min。
4. 加入0.9ml SOC,于37℃恒温摇床上200rpm×1hr温育。
5. 将菌液4000rpm/min离心3min,留200μl上清将菌体打散,均匀涂布于含适当抗生素的琼脂平板表面,平板于37℃倒置培养过夜。
i. 注:新倒的平板可于37℃培养箱中预先放置数小时至过夜干燥。
ii. 当转化的是TA克隆连接产物时可在菌液中加入8μl 1M IPTG和40μl 20mg/ml X-gal以进行蓝白斑筛选。