去年冬天
第1楼2011/07/23
(2)针对任意引物PCR 由于临床分离株绝大多数含有tdh基因,因此绝大部分研究者都根据tdh设计引物进行特异扩增。1993年,Lee等根据tdh基因设计引物,对36株TDH+株、89株TDH-株以及46株其他弧菌和肠道菌进行PCR检测。结果显示,36株TDH+株全部特异扩增出来,其余菌株都没有扩增;而检测灵敏度高,最低检测量可至40pgDNA,并可直接检测粪便标本,无需分离培养,方便快速。1999年,Kim等选择toxR基因序列设计两对引物,
5’--GTCTTCTGACGCAATCGTTG--3和 5’一ATACGAGTGGTTGCTGTCATG一3’,
对14株V.p、14株其他弧菌进行PCR。结果显示,14株V.p都得到一条368bp的特异扩增亮带,而其他菌株没有特异扩增。此外,Venkateswaran等选择gyrB基因设计引物对V·p进行PCR、Cordova等选择pR72H基因设计引物进行PCR,特异性、灵敏度都很好。
(3)多重PCR 由于不是全部副溶血性弧菌都含;tdh基因或,trh。基因,所以只针对tdh或trh的单一PCR,有时会漏检。多重PCR(multiplex-PCR)能全方位高效率地检测Vpo1994年,Bej白等针对“、tdh、trh设计不同的引物对,在同一PCR反应体系内同时扩增tl、tdh、trh。结果显示,所有的V。p都扩增出“基因,tl基因是V.p特异的;54%的V.p扩增出tdh基因;只有38.73%的V.p扩增出trh基因;该法灵敏度高,能把log牡蛎培养肉汤里10~100个V.p检测出来。与其他常规生化方法相比,多重PCR更快速,仅8h就能完成检测,结果更为准确、可靠,而且还可改进成定量竞争PCR,对标本中靶序列进行定量。
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(4)实时PCR 常规PCR检测,需要从反应体系中吸取产物做电泳或Southern杂交等试验进行鉴定,转移过程中易污染,造成假阳性,而且耗费时间。1996年,Tyagi开创了一种实时PCR(Real-timePCP,)。实时PCR是在,PCR反应体系中加入标记有报告基团和淬灭基团的线性Taqman.探针或茎环型荧光分子信标探针,在墓因扩增过程中,与产物杂交,此时,报告基团和淬灭基团分开,根据能量共振转移现象,报告基团发出荧光而被检测。这种方法操作简单,闭管检测,减少污染,灵敏度高,并且可以在PCR结束或PCR过程进行同步定性或定量检测,面且可以进行临床大规模快速检测。
2003年,Blackstone等针对tdh设计荧光分子信标探针,对从牡蛎中富集的13个不同种类的菌株进行实时PCR检测。结果显示,只有含tdh的V.p才被检测出来,特异性好,灵敏度高,能把每个纯培养体系的1个CFU检测出来。实时PCR检测快速准确,但需要价格昂贵的荧光检测仪和荧光分子标记探针,一般的实验室不能广泛开展。分子信标实时PCR技术自1996年开创以来短短几年就得到蓬勃的发展,相信随着经济的发展、技术的进步、实时荧光检测仪的昔及,将会得到更为广泛的应用。