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化学信息学: (1)-3-7 分子式索引/环系索引/母体化合物

sslin

2011/10/19

北大林崇熙教授专版

(1)-3-7 分子式索引 (Formula Index, FI)
分子式索引于 1920 年第 16 卷起推出. 报导的内容简洁, 只提供化合物的名字、登记号与文摘号三种信息 (下图), 是辅助索引. 需要进一步了解化合物的详细信息则需要查找化学物质索引. 使用分子式索引的时机包括不清楚化合物的命名, 以及快速了解某化合物是否有人研究过.
CA 对分子式的编排采用简单易记的 Hill 系统, 而不用 20 世纪初盛行的 Richter 系统 (Richter 系统字母次序为 C, H, O, N, Cl, Br, I, F, S, P 等, 例如 C₁₀H₅ON₄BrS). Hill 系统以 C, H 为主体, 然后其它原子按照英文字母顺序排列, 例如 C₁₀H₅BrN₄OS. 如果化合物没有 C, 则全部按照字母次序, 例如氢溴酸为 BrH. 想进一步了解 Hill 系统可以查阅 J. Am. Chem. Soc., 1900, 22 (8), 478-494.
有些结构不明确的化合物在分子式索引中暂不命名, 但提供沸点、熔点、质谱等理化数据. 对于高聚物或有机盐 (如醇、酚、胺的金属盐) 的查阅从化合物的母体着手, 例如高聚物从单体; 季铵盐 (C₆H₅CH₂)(CH₃)₂(CH₃CH₂)N⁺ I^- 从C₁₁H₁₈N; 乙醇钠 C₂H₅ONa 从 C₂H₆O 母体着手.
分子式索引的编排、阅读与查找范例如下:

练题 1: 查 1997 年 126 卷报导下列化合物 (分子式 C₁₉H₂₀ClN₃S) 的文摘
Piperidine 1-[(4- chlorophenyl)methyl]-4-[5-thienyl]-1H-pyrazol-3-yl
答案 1: 126: P31349v

练题 2: 查 1992-1996 期间报导 dichlorodiiodomethane (CCl₂I₂) 的文摘号
答案 2: 117: 14730j; 120: 63571d; 120: 106321s

练题 3: 查 2002 年 136 卷报导分子式 C₂₈H₃₇NO₂ 化合物为 phenol 衍生物的文摘号与全名.
答案 3: 137: P78952d (自 ₁₃₇F₄),
1H-Imidazole-5-methanamine,1-butyl-N-[(4-methoxyphenyl)methyl]-24-
diphenyl-n-[(2,4,6,-trimethoxyphenyl)methyl]-[439564-07-5]

练题 4: 查1987-1991 期间 C₂₂H₂₁ClN₂O₅ 属于苯甲酸衍生物类化合物的文摘号.
答案 4: 108: 150100v; 106: 138328b; 110: P 154311d

(1)-3-8 环系索引 (Index of Ring System)
环系索引于 1916 年推出. 虽然有单独出版, 但是由于内容量少 (每期 50 页左右), 并且和分子式相关, 经常附在分子式卷索引的最末部分. 例如在 103F2, 117F3 中 (分子式索引 103, 117 期分子式索引第 2 与第 3 本后面).
环系索引是一种辅助索引, 没有文摘号, 只提供复杂环状化合物的骨架结构名称, 有助于对环状化合物命名的理解, 然后转查 CSI (化学物质索引).
查找环系索引, 需要了解多环系的定义. 二环以上需要有共用的点 (如 spiro) 或边 (fused ring). 对于 bi-phenyl, 由于没有共用原子, 属于单环系. 几个 1-3 环系化合物的例子 (包括环系, 各环原子数, 各环原子种类, 结构名称) 如下.

练题 1: 自 Ring index 1992 年下半年 (于 Formula index, ₁₁₇F₃末) 查
C₅-C₅-C₆ -C₆-C₆ fluorene 类化合物的名字.
答案 1: Indeno [1.2-b] fluorine

练题 2: Ring index 查 1986 年上半年 (于 Formula index ₁₀₄F₂ 末) 查
C₄O₂-C₇ 几种可能化合物的名字.
答案 2: i). 5H-cyclopenta-1,4-dioxin
ii). 6,7-Dioxabicyclo [3.2.2] nonane
iii). 1,5-Dioxaspiro [5.6] dodecane

(1)-3-9 母体化合物手册 (Parent Compound Handbook)
针对愈来愈复杂的环状与笼状结构化合物的出现, CA 在 1976 年创造了母体化合物手册, 将其分成四种母体结构 (cage parents 笼状母体, acyclic stereo parents 非环立体母体, cyclic stereo parents 环立体母体, ring parents 环系母体), 每个化合物都给出 6 种索引信息, 包括: registry number index, parent formula index, WLN index, parent name index, ring substructure index, parent analysis index, 如下图所示.

内容非常报导丰富精彩, 但是其中涉及到的检索过于专业, 例如 WLN 信息属于比较艰深的物化化学结构知识, 无法普及化. 导致本索引出版没有多少年, 便被放弃. 因为大众仍喜欢使用比较简明易懂的环系索引. 由于艰深并且已遭放弃, 本文只简单介绍背景知识. 好奇者可以到图书馆寻此手册, 由首页的说明自行研读了解.

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yuduoling

第1楼2011/10/19

到哪里去找这个手册呢

0

sslin

第2楼2011/10/20

图书馆的美国化学文摘期刊库房.

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