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求助!如何分析这个质谱图?判断其是不是我目的多肽

  • yjihicvtkd
    2012/09/21
  • 私聊

液质联用(LCMS)

  • 老师们,我现在做一个多肽的纯化,先是样品液过液相色谱柱,收集的峰拿去打质谱
    但是对于图如何解析却无从下手!!

    我的目标多肽是4726分子量,43个氨基酸,其中8个半胱氨酸,PI为8.5。
    这是其中收集的一个峰打出的质谱图,大家帮看看怎么解谱呢???怎么判断是不是我要的多肽呢?

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  • yjihicvtkd

    第1楼2012/09/21

    这个图有点大,我截成两段。
    已知的是后面的922 1221 是参比峰

    听说有根据多肽的电荷数来计算质谱峰的,如果电荷数为N,
    则 分子量/N +1=(质谱图中)m/z

    但是不知道如何确定这个多肽的电荷数呢?

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  • dark_wzy

    第2楼2012/09/21

    应该去借助软件来分析吧。电荷数可以根据两个相邻同位素峰之间的质量差来判断,电荷数=1/质量差。

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  • yzulcl

    第3楼2012/09/21

    应助达人

    看起来信号不够强啊。样品的信号不强,参比的922、1222也不够强。
    TOF的信号要到10^5会比较理想,最起码要到10^4才够看。仪器没调好吧?

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  • maldiguy

    第4楼2012/09/22

    一言以蔽之,从图中看不到你的多肽

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  • 徐有才

    第5楼2012/09/26

    是啊 你的信号太弱啦根本看不见啊~~

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  • chy57589893

    第6楼2012/09/26

    我也是感觉信号有些弱。从第一张图上基本看不出来有用的信息,LZ可以多做几张发上来,增加下信息量

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  • yjihicvtkd

    第7楼2012/09/27

    谢谢大家!
    仪器应该怎么样调呢?
    之前做的质谱skimer 电压为65V,后来一个老师说电压大了,就调到了35V
    还有一个问题,我把样品用C8柱子分离的时候,流动相 A相:超纯水加0.5/1000的TFA,B相:乙腈加0.5/1000的TFA ,收集的峰去打质谱。 据说TFA会抑制质谱信号,这里面是不是抑制掉了呢?

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  • yjihicvtkd

    第8楼2012/09/27

    真个学习啦!
    有什么软件呢?可以推荐下吗?

    dark_wzy(dark_wzy) 发表:应该去借助软件来分析吧。电荷数可以根据两个相邻同位素峰之间的质量差来判断,电荷数=1/质量差。

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  • yjihicvtkd

    第9楼2012/09/27



    这个是我后来把样品冻干,然后用少量10%乙腈溶解后,纯化出来的一个峰打的质谱,大家再帮分析一下,谢谢啊

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  • happy爱米粒

    第10楼2012/09/28

    TFA对负模式影响较严重,慎用

    yjihicvtkd(yjihicvtkd) 发表:谢谢大家!
    仪器应该怎么样调呢?
    之前做的质谱skimer 电压为65V,后来一个老师说电压大了,就调到了35V
    还有一个问题,我把样品用C8柱子分离的时候,流动相 A相:超纯水加0.5/1000的TFA,B相:乙腈加0.5/1000的TFA ,收集的峰去打质谱。 据说TFA会抑制质谱信号,这里面是不是抑制掉了呢?

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