柱表面破损易导致石英毛细管的断裂。涂有聚酰亚胺涂层的石英毛细管柱对潮湿水分比较敏感,一旦柱外聚酰亚胺保护层出现擦痕破损,就为水分的进入提供通道,擦痕与水分接触并不断蔓延,导致聚酰亚胺涂层的破裂、石英柱的断裂。如果在高温运作时发生柱子断裂,柱子通常由于接触空气而受到破坏。
柱子易断裂的程度与柱子直径有关。0.53mm内径毛细管柱往往要比窄径毛细管柱(0.25mm或更小内径)容易断裂。内径0.53mm的柱子不能耐受小于2cm半径范围的弯曲,0.25mm内径的柱子不能耐受小于lcm半径范围的弯曲。施加于柱上的压强越大,柱子越容易断裂。