GCMSSolution色谱质谱数据工作站质谱库基本操作
概述
GCMSSolution工作站自带有质谱谱库编辑器，可以进行质谱库内容查阅、用户自建谱库等功能，不需要调用其他第三方软件，操作方法较为简易。
Shimadzu的NIST谱库安装光盘中也保存有AMDIS、MS Seach、MS Interpreter等工具，也可以进行质谱数据的处理，不过预先需要将岛津的质谱数据另存为AIA格式。
简介
第一节 质谱库的安装
GCMSSolution工作站支持NIST/EPA/NIH或其他商用质谱库（例如Wiley质谱库），在预先已经安装GCMSSolution工作站的电脑上，运行NIST安装光盘内的setup程序，系统自动弹出“Nist Library安装向导”界面，并自动完成安装操作，如图1所示。
图1 Nist Library安装向导界面
NIST质谱库由24个文件组成，分别隶属于NIST20-1、NIST20-2、NIST20s三个子库，所有文件均安装在C:\GCMSSoluiton\library目录下。分子量小于500的化合物信息存储于NIST20-1子库中，分子量大于500的化合物纤细存储于NIST20-2子库中，每个化合物对应一张质谱图，作为标准质谱图。其他来源的质谱图作为补充，存储于Nist20s子库中。
谱库文件后缀的意义如下所示：
NIST20-1.LIB 存储NIST谱库首要信息，包括化合物分子量、化合物信息、CAS号。
NIST20-1.FOM 存储化合物分子式
NIST20-1.SPC 存储化合物质谱图
NIST20-1.NAM 存储化合物名称
NIST20-1.STR 存储化合物结构图
NIST20-1.NCV 存储化合物索引
NIST20-1.ADD 存储化合物谱图信息
NIST20-1.C2S 存储化合物在不同子库之间的索引
第二节 质谱库内容检索
在日常GCMS分析中，可以通过质谱库的检索，获取待测组分的特征离子、保留指数等质谱信息，可以提高分析效率。
例如色谱工作者在进行复杂色谱图的某组分定性操作时，可以首先查阅到目标组分的特征离子，叠加显示于TIC色谱图上，那么可以预先缩小相似度检索的范围，以提高工作效率。或者筛选掉相似度检索给出的明显不合理结果，例如TIC色谱图中保留时间较短的组分色谱峰，相似度检索返回了保留指数较大结果，显然是不合理的，可以将此条候选记录筛选掉。
质谱库内容检索的操作步骤：
1 运行GCMSSolution再解析，点击“助手栏”中的“谱库编辑器”图标，如图2所示。
图2 谱库编辑器
然后点击“文件”-“打开谱库文件”，选择合适的质谱库，如图3所示。
图3 选择质谱库
在工作界面的“索引”列中，选择合适的索引，例如“分子式”，如图4所示。
图4 选择索引
在工作界面的“参数”列中，输入需要检索物质的分子式（以乙醇为例，输入C2H6O，需要注意字符的大小写），如图5所示。
图5 输入分子式
点击“开始索引检索”按钮，工作站将给出乙醇的质谱信息，包含质谱图、结构式、CAS号、英文名称、保留指数、分子量等信息，如图6所示。
图6 索引检索结果
第三节 用户自建质谱库
点击GCMSSolution再解析部分“辅助栏”中的“谱库编辑器” ，点击“文件”-“创建个人谱库”，并命名和保存，如图7所示。
图7 新建质谱库
这样就建立了用户质谱库，谱库内无质谱记录。可以用两种方法，向该质谱库中添加记录。
1 从其他谱库复制。
打开其他质谱库文件，在该谱库中点击需要导入自建库的化合物记录，工作界面中出现该物质的质谱信息。
图8 其他质谱库
在该物质的质谱图中点击鼠标右键，弹出菜单中选择“复制到其他谱库”，如图9所示。
图9 复制到其他质谱库
弹出界面中，选择“自检质谱库”，该条记录被加入到自建质谱库中，如图10所示。
图10 选择自建质谱库
2 从数据文件提取质谱。
打开SCAN方式采集到的数据文件，双击目标组分色谱峰，并进行质谱背景扣除，获取最终的目标组分质谱图，如图11所示。
图11 获得目标组分质谱图
点击GCMSsolution再解析菜单栏中的“定性”，选择“注册当前质谱到谱库”，如图12所示。
图12 注册到谱库
在弹出界面中，选择需要导入的自建质谱库，如图11所示，该质谱信息将被记录到自检质谱库中，并在弹出的界面中编辑组分信息，如图13所示。
图13 编辑组分信息
第四节 自建库中记录的忽略
严格说来自建谱库的内容是只读的，不可以删除。但是可以设定将某条记录在检索中隐藏。
打开自建质谱库后，点击“文件”-“删除检索结果中忽略的组分”，该条记录将不再会被检索到，如图14所示。
图14 忽略记录
小结
简单说明GCMSsolution的质谱谱库操作方法。
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