方法1：甘油保菌法。
适用范围：菌种的中长期保藏，保藏时间可在1年以上。
操作方法：由于甘油本身十分粘稠，很难定量，因此一般将甘油和水按1:1的比例配成终浓度为50%的甘油溶液，进行灭菌处理。使用时，按50%甘油：菌液=1:1的比例混合，使甘油终浓度在20-30%即可，甘油浓度过高或过低都不利于菌种保藏。再将甘油菌种转移至-80℃冰箱长期冻存。方法2：斜面保菌法。适用范围：菌种的短期保藏。操作方法：将菌种接种在适宜的固体斜面培养基上，待菌充分生长后转移至4℃冰箱中保藏。保藏的时间根据微生物的种类而不同，一般霉菌、放线菌及产芽孢的细菌保存2-4个月就需要移种一次，酵母菌为两个月，而细菌最好一个月移种一次。方法3：穿刺保菌法。适用范围：菌种的短期保藏。操作方法：准备一管半固体培养基，用接种针挑取菌种，自半固体培养基的中心垂直刺入，直至接近试管底部，但不要穿透，然后沿原穿刺线将接种针退出，于4℃冰箱保存。此方法同斜面保菌法一样需要定期移种。方法4：沙土保菌法。适用范围：菌种的中长期保藏。操作方法：将培养好的菌种与无菌沙土混合，使菌体吸附在沙土载体上，干燥后转移至4℃冰箱保存。需要取用菌种的时候，取出少量沙土颗粒即可。方法5：冷冻干燥法。适用范围：菌种的长期保藏。操作方法：将菌种冷冻，在减压条件下，利用升华作用去除其中水分，使细胞的生理活动趋于停止，从而使菌种长期维持存活的状态。需要取用菌种时，用无菌水或培养基重悬菌体，将菌悬液转移至固体培养基平板上进行培养。
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