①食品发酵领域：优化发酵工艺、功能成分挖掘、创新生产模式等；②食品营养与健康领域：个性化营养、功能食品开发、营养素吸收利用机制等；③食品安全与质量控制领域：食品质量管控、标准制定与法规完善、溯源追踪等；④食品加工与贮藏领域：提升食品质量、延长货架期、降低营养流失、开发新型食品等；⑤其他方面：食品感官科学、新型食品包装材料、食品大数据与信息化等；
①需要明确研究的具体目的，比如是探索某种食品的功能性成分、评估食品加工对营养成分的影响、解析食品中潜在的有害物质、还是研究食品与人体健康的相互作用等；②根据研究目标选择合适的样品，通过不同组学，结合生物信息学工具，识别关键的微生物、基因、转录本、蛋白质和代谢物/风味物质；③进一步通过多组学数据整合分析，建立微生物-基因-转录-蛋白-代谢物/风味物质之间的关联网络，深入理解食品的生物学机制；④基于多组学分析结果，选择关键候选因子进行体外或体内实验验证，如关键微生物的纯培养验证、功能基因的过表达/敲低实验、蛋白质功能分析、代谢途径干预等，以验证假设并探索其作用机制。
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