生物标志物

赛默飞世尔科技成立全新生物标志物转化中心目标是加速以质谱技术为基础的生物标志物研究，并加速这种研究应用到日常临床试验的开发中 　　中国上海，2011年9月13日——全球科学服务领域的领导者，赛默飞世尔科技(以下简称：赛默飞)于2011国际人类蛋白质组(HUPO)大会上宣布成立全新生物标志物转化中心(BT中心)。BT中心的目标是加速以质谱技术为基础的生物标志物研究，并加速这种研究应用到日常临床试验的开发中，以最终实现商品化。该中心位于马萨诸塞州剑桥，汇集了来自赛默飞BRAHMS产品线及质谱生物标志物研究(BRIMS)中心的专家。 　　“我们对BRIMS中心负责质谱生物标志物研究和高通量定量试验开发的专业人才进行了纵向整合，目标是扩大新蛋白质和肽生物标志物的应用及临床试验的潜力，”赛默飞BRAHMS生物标志物研发总监Bruno Darbouret如是说，“这一发展最终将加速疾病诊断测试的商品化。” 　　赛默飞拥有专利Thermo Scientific BRAHMS生物标志物，现已成为专业体外诊断测试的领先供应商，不仅充分了解临床市场的需求，并将致力于诊断开发、验证及商品化，为BT中心确定重点疾病领域。公司与临床研究人员所建立的良好关系将有助于获取临床合作伙伴和病人样品，有利于利用BRAHMS生物标志物开展研究和验证工作。 　　针对所选的疾病领域，BRIMS中心将致力于以质谱定量技术为基础的生物标志物研究和多重选择反应监测(SRM)试验的开发工作，以识别潜在生物标志物及其与临床相关的异构体。随后将开发可靠、可重现的目标质谱试验方法用于验证潜在生物标志物，并最终应用于临床诊断市场。 　　赛默飞将拥有所有生物标志物及试验相关的知识产权，并且在获得所有所需的法规批准后，将试验商品化为临床诊断产品和服务。 　　“将质谱生物标志物研究有效转化为日常临床诊断试验开发是个体化医学领域一项重要的挑战，”BT中心团队负责人Bryan Krastins如是说，“要想弥合这两者间的差距，必须在质谱生物标志物研究和日常试验开发方面具有非常出色的能力。了解临床医师和病人的需求、拥有丰富的临床验证经验，这是将新兴测试转化为日常临床试验的必备条件。全新的BT中心整合了所需的所有能力，旨在加速从生物标志物研究到临床试验开发和验证的整个过程。” 　　Thermo Scientific BRAHMS产品线包含一系列诊断测试流程，以改善对危害生命的疾病的诊断和治疗，利用专利生物标志物为病人和用户提供更经济、更专业的诊断技术。Thermo Scientific BRAHMS产品已应用于全球各地超过60个国家。 　　位于马萨诸塞州剑桥的BRIMS中心为蛋白质生物标志物的识别和验证开发了一系列方法和应用。该中心配备完整的Thermo Scientific质谱仪产品，由质谱、蛋白质技术和信息学等领域的专业科研人员组成，同时也负责开发针对蛋白质组学研究的软件工具。 　　欲了解更多关于赛默飞蛋白质组学研究的解决方案，请拨打电话800 810 5118 或400 650 5118，发送邮件至cru.cn@thermofisher.com，或登录网站http://www.thermo.com.cn/ms。 　　关于赛默飞世尔科技 　　赛默飞世尔科技(纽约证交所代码：TMO)是科学服务领域的世界领导者。我们致力于帮助我们的客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额接近110 亿美元，拥有员工约37000人。主要客户类型包括：医药和生物技术公司、医院和临床诊断实验室、大学、科研院所和政府机构，以及环境与工业过程控制行业。借助于Thermo Scientific 和Fisher Scientific 两个首要品牌，我们将持续技术创新与最便捷的采购方案相结合，为我们的客户、股东和员工创造价值。我们的产品和服务有助于加速科学探索的步伐，帮助客户解决在分析领域所遇到的各种挑战，无论是复杂的研究项目还是常规检测或工业现场应用。 欲了解更多信息，请浏览公司网站：www.thermofisher.cn

导读代谢组学(Metabonomics / Metabolomics)是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科，是系统生物学的重要组成部分，已经应用到了诸如动物、植物、微生物的机理研究中，着重探索、发现与疾病、医药、功能相关的生物标志物(Biomarker)。生物标志物是指“一种可客观检测和评价的特性，可作为正常生物学过程、病理过程或治疗干预药理学反应的指示因子”，寻找和发现有价值的生物标志物已经成为当前生物、医药领域的研究热点。然而，生物标志物的发现，是一场砂砾淘金、去伪存真的艰难征程，面临诸多挑战。 挑战1 生物标志物的发现，海量筛选，准入高，难度大 相比于基因组学和蛋白组学，代谢组学难度急剧增加。原因有： 1. 目标物范围更广：基因/转录组只需测4种核苷酸排列，蛋白组测20种氨基酸排列，代谢组则包含各类小分子代谢物，要进行结构鉴定可比大海捞针； 2. 需要交叉专业知识：如将代谢组学应用在生物研究中，需要分析化学背景进行分离检测，这些数据的正确解析和可视化需要有统计分析的基础；最后需要了解生物学知识以诠释数据背后的生物学意义； 3. 软硬件要求高：使用的分析体系大都属于高端仪器及其配套软件，比如色-质谱联用系统里色谱可选GC-MS，LC-MS，CE-MS，质谱根据靶向、非靶向可选QQQ，Q-TOF，IT-TOF等；海量数据采集完毕还需要专业、多功能数据分析平台解读数据，最后还要对潜在生物标志物进行结构鉴定，因此代谢组学每一步都是准入高，难度大！ 挑战2 如何去伪存真，减少无意义差异物，找到真正的生物标志物 代谢组学巨大的挑战之一，是如何减少生物样品本身，或采集、保存、前处理和分离检测过程中产生“非预期”或“噪音”代谢物，从而去伪存真，找到真正的差异生物标志物： 1. 个体情绪差异、非目标病因的生理差异（近期饮食习惯、喝水量、排尿量、运动量、生病、过敏）、其他药物的耦合作用/副作用，都会对个体代谢物产生非预期的影响； 2. 在采集样本时，如血样、组织、器官，采集者参差不齐的技术熟练度也会引入其他刺激和干扰因素； 3. 样品的保存同样会引入大量干扰物或造成样品变化。比如保存前是否存在溶血，保存温度，冷冻时间长短等，都会使样品产生不可预期的变化； 4. 不同的样品前处理手段，如液液萃取、固相萃取、蛋白沉淀等，其化学、物理选择性不同；另外，操作人员的熟练度、溶液量、溶液污染、萃取柱批间差等样本外的误差，都可能会造成样品组内和组间差异。 海量的待选小分子目标物，加上上述这些“不确定性”和“科学偏差”产生比生物标志物浓度更高、响应更强的无意义组别差异物，使得代谢组学在生物标志物发现的路上，困难重重，犹如大海捞针，沙里淘金。虽然后续的统计分析会把大多数的这类干扰物去除，却不能保证最终能得到正确的生物标志物，或使其处于最显著地位。 虽然代谢组学研究困难重重，但经过多年的研究探索，科研界都认同利用代谢组学的思路发现生物标志物是方向正确、前景广阔的，相信随着分析仪器，特别是高端质谱及其配套软件和科学家研究水平的提高，越来越多有用的生物标志物会被挖掘出来造福于人类。 岛津是全球领先的质谱研发、生产厂家：从上世纪70年代开始研发扇形质谱，成功生产了世界上第一台商品化扇形磁场型质谱GCMS LKB9000；80年代开发了基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF）和电感耦合等离子体质谱（ICP-MS），岛津科学家田中耕一先生在2002年因为MALDI离子源的研发获得了诺贝尔化学奖，因此岛津拥有深厚的质谱研发基础和实力。 目前岛津质谱的产品线齐全，有机质谱包括单四极杆质谱（SQ）、三重四极杆质谱（TQ）、高分辨质谱离子阱飞行时间质谱（IT-TOF）和四极杆飞行时间质谱（Q-TOF）；无机质谱有ICP-MS；生命科学领域有MALDI-TOF、质谱显微镜等。这些质谱仪器与分离技术联用，满足科学研究的各种需求。基于岛津高端质谱，国内高校研究所发表了多篇代谢组学用于脑卒中、癌症和动物生理相关的生物标志物发现的文章，在此系列微信中挑选出典型案例，帮助读者进一步了解疾病和生理现象。

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