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DNA片段的克隆需要合适的载体,载体或是质粒,或是噬菌体,或是病毒,通常大多经过人工改造http://www1.qiagen.com/ literature/pqesequences/pqe3x.pdf2. http://allergy.dlearn.kmu.edu.tw/Protocol.Vectors/Qiagen.pQE30_pqe3x.pdf 多克隆位点 http://www1.qiagen.com/literature/pqesequences/pqe3x.pdf 载体基因序列 1. http://www.tcd.ie/Genetics/staff/Noel.Murphy/recombinant%20dna%20ge4021/pqe30.doc2. http://www1.qiagen.com/literature/pqesequences/pqe-30w.txt 纯化方法 http://www.biochain.compCNDA3 5446bp Ap T7启动子 质粒图谱 http://depts.washington.edu/~bornlab/vector/map/pcdna3-map.html 多克隆位点 http://depts.washington.edu/~bornlab/vector/map/pcdna3-map.html 载体基因序列 1. http://seq.yeastgenome.org/vectordb/vector_descrip/COMPLETE/PCDNA3.SEQ.html2. http://www.genomex.com/vector_sequence/pcDNA-3.txt3. http://image.llnl.gov/image/dyn_html/bin/full_seq.pl?vec=pCDNA3&seqno=45pCDNA3.1 5446bp Ap T7启动子 质粒图谱 1. http://www.genomex.com/vector_maps/pcdna3.1+.pdf2. https://www.invitrogen.com/content/sfs/vectors/pcdna3.1+.pdf 多克隆位点 https://www.invitrogen.com/content/sfs/vectors/pcdna3.1+_mcs.pdf 载体基因序列 1. http://seq.yeastgenome.org/vectordb/vector_descrip/COMPLETE/PCDNA3.SEQ.html2. http://www.genomex.com/vector_sequence/pcDNA-3.txt3. http://image.llnl.gov/image/dyn_html/bin/full_seq.pl?vec=pCDNA3&seqno=45 载体内部酶切图谱 https://www.invitrogen.com/content/sfs/vectors/pcdna3_1p_rest.pdf PTYB1 7477bp Ap T7lac启动子 质粒图谱 http://www.neb.com/nebecomm/tech_reference/restriction_enzymes/maps/pTYB1_map.pdf 多克隆位点 http://www.neb.com/nebecomm/products/productN6706.asp 载体基因序列 http://www.neb.com/nebecomm/tech_reference/restriction_enzymes/sequences/ptyb1.txt 载体内部酶切图谱 http://www.neb.com/nebecomm/tech_
区别呢 原核表达载体 在原核生物表达 ,真核的在真核表达 很像废话 呵呵呵呵。。。。 就是 原核载体可以将真核基因表达,但是表达出来的蛋白是没有活性的,因为缺少翻译后修饰系统。。。真核的表达载体呢 由于比较大 不适合大量快速扩增,所以要在其载体上构建可以在原核生物 如大肠杆菌中复制的所需的复制原件 。。。。综上 在应用的时候 要构建 穿梭质粒 可以穿梭于 原核和 真核 呵呵 还有就是 原核表达载体的基本元件和真核的有不同的地方 。。。。。总觉得不够正确答案 。。。。。有些人缘的蛋白在原核里没有蛋白翻译后修饰,表达后没有活性,这时候就得在真核里表达了原核表达做抗体,真核表达做功能研究。(1)原核载体,将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点:易于生长和控制;用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵;有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择。但是,在大肠杆菌中表达的蛋白由于缺少修饰和糖基化、磷酸化等翻译后加工,常形成包涵体而影响表达蛋白的生物学活性及构象。 你可以就其在蛋白纯化等方面的作用进一步进行说明。(2)真核载体,要表达真核生物的蛋白质,采用真核表达系统自然应比原核系统优越,常用的酵母、昆虫、动物和哺乳类细胞等表达系统。真核表达载体的应用比较广,通过真核表达,可以研究某一基因的功能,比如把载有目标基因的载体导入到特定的哺乳动物细胞中以后,如果该基因发挥着某种功能,则可以通过其引起细胞的变化来说明问题等等。你可以搜索一下,这方面还是很多的。
个人载体构建心得这两年在美帝净做克隆实验了,以前读PHD时候还觉得自己分子克隆挺牛X的,来这边之后做了各种各样的构建才知道以前是坐井观天,刚才粗粗统计了一下,在美帝一年零八个月,我构建的质粒超过四百个,其中有很简单从PCR构建到拿WB结果的一共不到一周,也有巨难的花了四个月时间换了几次strategy才弄好激动得我半夜給老板发信的品种;有单片段酶切插入这种不用脑型的,也有九个片段逐一插入正反向还不同的。专家不敢说,但是熟能生巧,确实积累了不少经验,现在系里从POSTDOC到PHD学生到TECH构建前很多人都跟我商量(做博后结果成了技术员的人生真悲哀啊)。我老板甚至开玩笑说,我们将来开个公司,我专门负责构建(这话听得我想揍他大家同意不?)想了想还是把经验写下来,一来做个记录,二来博同行一笑,能让大家少绕点弯路则更好。1. 准备工作俗话说用欲善其事,必先利其器。我强烈建议大家在做构建之前先找好工具,这样起的效果事半功倍。这里说个笑话,我们系有个新PHD学生,是个印度女孩,很聪明很刻苦,她所在的实验室也很好,不过除了她之外包括老板在内都是生物物理背景的,以前一个生物POSTDOC在的时候还好,这个POSTDOC一走,整个实验室对分生就只有一个粗浅的概念,这个女孩就想把一个质粒上的基因插到另一个质粒上去,要是我就先查查有没有合适的酶切位点,要没有就改造一下质粒一切搞定,这女孩她不懂啊(要命的是她老板固然牛,对这方面也不懂),自己辛辛苦苦设计了PCR引物去做PCR,P了将近5K的产物去测序,结果测的结果中间有个MUTATION,要懂行的就找找酶切位点,从原来的替换上去,然后测下这段就行。她呢,又送去了若干了质粒一个接一个的测,一个测序反应这边是8刀,一个质粒测下来就是40刀,她光测序就要花好几百刀(你得佩服老美实验室真有钱呀)。这件事教育我们准备工作是多么重要!这里推荐大家两个工具,一个都知道,PRIMER5.0。另一个工具极强大,也不知道国内流行不,叫lasergene,也就是DNAStar包括设计引物到构建图谱一应俱全,图谱非常漂亮,而且分析酶切位点等等就超NB,如果感兴趣的话我可以給大家传一个图谱看看。2. PCR如果没有现成的质粒可供酶切,PCR是最理想也是最方便的策略。关于PCR具体技术坛子内帖很多,我不多说了,这里仅在构建方面谈一谈。如何设计引物?首先,看懂质粒图谱!拿大家比较熟悉的PEGFP-C1和PEGFP-N1做例子。想用N1质粒,设计引物就得把下游引物上的中止密码子去掉,不要辛辛苦苦的一路做下来结果根本不表达融合蛋白,你就死了;C1质粒,注意frame,要是移码了,你也死了。而且PEGFP系列有1、2、3,要弄清楚别弄窜了。一句话,要看懂你的图谱!再多一句,PEGFP的XBA1和Bcl1位点不能用。注意在设计酶切位点的时候要加保护碱基(大家要用T载体就当我没说)。酶切位点设计也有一定的讲究,我的原则是,能用粘端就用粘端,实在不能用的就用只好用一些常用的平端酶,如ECORV和SNAB1之类,要是以后还有别的用处就多加点酶切位点,我曾一口气在引物上加了五个酶切位点以防以后要用到,注意计算TM的时候要减去这些不match的序列,或者选用touch-up策略。除了酶切位点,还要注意KOZAK序列的问题,很多质粒没有提供KOZAK序列,这要在设计的时候直接在引物上加好。GENE OVERLAP也比较有用,比方说加个FLAG片段,HIS片段,2A