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【讨论】土壤DNA提取及细菌16S rDNA PCR扩增问题,寻求大家帮助!急!

  • chengjianzhong
    2009/10/19
  • 私聊

PCR

  • 我用MO Bio的soil DNA Isolation Kit提取土壤总DNA,提取的DNA直接跑胶,看不见任何条带,采用细菌16S rDNA通用引物(27F和1492R)进行PCR扩增,也没有结果,有一次我将试剂盒提取的DNA50倍稀释后,进行细菌16S rDNA的PCR扩增,扩增出了目的条带,我所用的酶为Takara的LA Taq,用普通的Taq酶扩增不出来,但隔了一周后再去重复,什么条件都一样,却再也扩不出来了,我重新提取了新的DNA进行PCR,依然没有结果,不知道是什么原因,请大家帮忙分析一下,希望有做过土壤微生物多样性的高手提供点提取土壤DNA以及扩增细菌16S rDNA的实验方法,我将不胜感激!我现在非常着急!希望能尽快得到大家的帮助!
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  • swingdog

    第1楼2010/03/24

    土壤里面腐殖酸含量比较高,纯化过程也很难完全去除掉,这个对PCR会有抑制,所以稀释后腐殖酸浓度也降低了,就能P出来;但跑胶没有条带但稀释后却能P出来还是挺奇怪的~
    PCR的成功率本来就不是100%,影响因素很多,有的时候是完全想不到的因素导致的P不出来,还是要多做,摸索出最优条件才能提高点成功率,不过P不出来的时候还是挺痛苦的~

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