省部重点实验室
第1楼2012/06/15
(2)逆转录及PCR扩增
SuperscriptTMⅡ试剂盒(Cat No:18064-022,Invitrogen公司),GIBCO BRL公司;RNAimage试剂盒,GenHunter公司;Taq DNA聚合酶和dNTPs,华美生物工程公司;寡核苷酸引物,上海生工生物工程公司合成;其它试剂均为国产分析纯产品。
(3)PAGE凝胶检测
100bp DNA ladder(Cat No:MG0911), 华美生物工程公司;丙烯酰胺,甲叉丙烯酰胺,BIOMOL公司;其它试剂均为国产分析纯产品。
1.4主要仪器
PTC-100[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp]基因扩增仪(Techne公司,英国),GeneGenius 凝胶成像系统(SYNGENE公司,美国)。-70℃超低温冰箱(Thermo Forma,美国),PCR超净台(基因有限公司,美国),DYY-Ⅲ-5型稳压稳流电泳仪(北京六一仪器厂), 5810R低温冷冻离心机(Eppendorf,德国),Micro-MB3616型高速离心机(IEC公司,美国),Vortex GENIE2(基因有限公司,美国),GeneQuant核酸定量仪(Pharmacia Biotech 公司,英国)。CS101-2A电热鼓风干燥箱(银河,中国重庆),DYY-111 12型三恒多用电泳仪(北京六一仪器厂),DYY-111 20A型DNA序列分析电泳槽(北京六一仪器厂),TY-80A脱色摇床(北京六一仪器厂)。
2 实验方法
2.1 总RNA的提取与检测
(1)用品的准备
塑料器皿,如离心管、Tip头等用0.1%的DEPC水37℃浸泡12小时以上,高压灭菌并烘干后使用;所用溶液用0.1%的DEPC水37℃浸泡12小时以上,高压灭菌后4℃保存;玻璃器皿经180℃烘烤12小时以上,冷却备用。
(2)试剂的配置
① CSB缓冲液
42mmol/L柠檬酸钠(Sodum citrate)
0.83%(W/V)十二烷基肌氨酸钠(N-lauryl sarcosine)
0.2mmol/L巯基乙醇(β-mercaptoethanol)(使用前加入)
(3)RNA提取
对悬浮培养细胞A<1>、B<1>进行RNA提取,提取步骤如下:
① 50ml离心管中加入10ml变性匀浆液,冰浴5分钟。
② 取0.5g细胞在液氮中研磨至粉末,转移至预冷的变性匀浆液中,加200ulβ巯基乙醇,振荡混匀。
③迅速加入1ml 2mol/L乙酸钠(PH4.0),充分混合。
④ 加入10ml水饱和酚,剧烈振荡10~15秒,在冰上放置5分钟。
⑤ 加入2ml氯仿:异戊醇(24:1),剧烈振荡10~15秒,在冰上放置15分钟。
⑥ 4℃,12,000g,离心20分钟。
⑦ 小心移取上层水相,弃去中间相和下层有机相。
⑧ 加入6ml水饱和酚,剧烈振荡10~15秒,在冰上放置5分钟。
⑨ 加入6ml氯仿:异戊醇(24:1), 剧烈振荡10~15秒,在冰上放置15分钟。