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如何利用Unscrambler进行SIMCA,求具体操作步骤

  • 另一个自己
    2013/10/05
  • 私聊

近红外光谱(NIR)

  • 首先,真的非常感谢回复我帖子的亲们,你们让我感受到关切,因为我们的陌生,更让我感到动容。谢谢athosm的建议,我已经做了修改。
    此外,这个问题我摸索了好几天了,也找了各种文献教程,但还是没有找到具体的操作。所以,再此烦请各位专家高手帮帮忙。

    根据已有文献,我想利用The Unscrambler 9.7中的SIMCA来实现枸杞的产地判别分析(即是否为中宁枸杞)。我导入的格式为JCAMP-DX

    遇到的问题:

    1.我想把导入的样品设为校正集和验证集,求如何设置?

    2.我加入了一列类别变量(Category variable),是中宁的设为yes,非中宁样品设为no。不知道这样是否正确?还是应该将中宁的设为1,非中宁样品设为0

    3.文献上说,“SIMCA 判别分析方法是对训练集中每一类样本的近红外光谱数据矩阵分别进行了主成分分析,建立每类样本的主成分分析模型,在此基础上将未知样品与各类样本数学模型进行拟合,确定其归属。”

    我点击 Task-PCA后,弹出的对话框中的 Samples-sample set,我应该只选择的yes(或者 no)系列的样品,建模;还是应该选择全部校正集的样品来建模呢?

    4.选定了主成分后,如何进行SIMCA建模?我在下拉菜单中没有找到SIMCA这个选项。

    附件是我将我的数据导入Unscrambler的原始数据。

    第一列为 类别变量:yes表示是我要的品种;no表示不是我要的品种。
    后面的都为进行了预处理的光谱数据。

    看到很多文献上说SIMCA能够实现品种判别,摸索了很久还是不懂,希望某位高手可以看到我的帖子,给我解答。
    希望帖子不要石沉大海才好,希望被专家高手看到呀。。。求人品
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  • 另一个自己

    第1楼2013/10/06

    为什么我的问题没人回答呢。。。求高手,求专家

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  • 武灵

    第2楼2013/10/08

    没安装这个软件,已经把附近给验证了,希望有这方面的专家帮你解答。

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  • 另一个自己

    第3楼2013/10/09

    非常感谢您的回复。帖子已经好几天了,都没人回。这个问题对我很重要。

    已经把附近的验证了?不怎么懂,求解释哈。。。

    我有这个软件安装包。我 Q272503600 不知您是否有空试试,帮我弄弄。

    武灵(zhonghuashendun) 发表:没安装这个软件,已经把附近给验证了,希望有这方面的专家帮你解答。

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  • athosmi

    第4楼2013/10/09

    SIMCA……好怀念呀。我只知道一点原理,没有正式用过……
    基本原理就是先对光谱提取因子(主成分因子,独立成分因子等等),然后进行因子分析。以下以主成分因子为例:
    在分析的时候,首先需要选择主成分个数,通常认为前几维主成分包含了光谱大部分信息,其后剩余的主成分就被当做是噪声不予理睬。
    SIMCA就是用前几维主成分进行识别分析后,对剩余的因子信息进行一个检验计算,检验的结果有否定之前判别结果的权利。
    Unscrambler我没用过,最好把你在使用过程中出现的问题一样一样列出来,这样版上的专家才能一样一样的帮你解决。

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  • 另一个自己

    第5楼2013/10/09

    非常感谢。。。已经修改了。还麻烦你看看,能不能给我支点招

    athosmi(athosmi) 发表:SIMCA……好怀念呀。我只知道一点原理,没有正式用过……
    基本原理就是先对光谱提取因子(主成分因子,独立成分因子等等),然后进行因子分析。以下以主成分因子为例:
    在分析的时候,首先需要选择主成分个数,通常认为前几维主成分包含了光谱大部分信息,其后剩余的主成分就被当做是噪声不予理睬。
    SIMCA就是用前几维主成分进行识别分析后,对剩余的因子信息进行一个检验计算,检验的结果有否定之前判别结果的权利。

    Unscrambler我没用过,最好把你在使用过程中出现的问题一样一样列出来,这样版上的专家才能一样一样的帮你解决。

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  • athosmi

    第6楼2013/10/09

    Unscrambler软件的 鉴别模型建立方法都有哪些?我没见过这个软件不太了解如何操作。

    对于lz提的一些问题,我个人的看法:

    1、建模集和检验集的设置,建议使用随机选取设置,这种功能通常软件都有,lz看看软件界面有没有相关的设置。或者在建立模型的时候软件会自动设置检验集(如TQ等软件)

    2、对于yes no或者0 1,对于软件来讲都是一样的,实际上就是分成两类,一类属于中宁枸杞,一类不属于

    3、建模时软件都是会根据设置的建模集样本和检验集样本自动进行建模,建模时只使用建模集光谱集,模型建立好之后自动使用检验集光谱验证模型。不需要想太多。

    4、这就涉及到软件是否具备SIMCA建模功能了。如果没有,你看看软件里是否有主成分鉴别或者类似的鉴别模型方法。SIMCA识别其实和主成分鉴别方法是类似的,只是多了一步剩余信息的统计检验过程。如果没有SIMCA选项就使用主成分鉴别方法配合统计 检验验证,结果基本是一样的。

    另一个自己(v2758843) 发表:首先,真的非常感谢回复我帖子的亲们,你们让我感受到关切,因为我们的陌生,更让我感到动容。谢谢athosm的建议,我已经做了修改。
    此外,这个问题我摸索了好几天了,也找了各种文献教程,但还是没有找到具体的操作。所以,再此烦请各位专家高手帮帮忙。

    根据已有文献,我想利用The Unscrambler 9.7中的SIMCA来实现枸杞的产地判别分析(即是否为中宁枸杞)。我导入的格式为JCAMP-DX

    遇到的问题:

    1.我想把导入的样品设为校正集和验证集,求如何设置?

    2.我加入了一列类别变量(Category variable),是中宁的设为yes,非中宁样品设为no。不知道这样是否正确?还是应该将中宁的设为1,非中宁样品设为0

    3.文献上说,“SIMCA 判别分析方法是对训练集中每一类样本的近红外光谱数据矩阵分别进行了主成分分析,建立每类样本的主成分分析模型,在此基础上将未知样品与各类样本数学模型进行拟合,确定其归属。”

    我点击 Task-PCA后,弹出的对话框中的 Samples-sample set,我应该只选择的yes(或者 no)系列的样品,建模;还是应该选择全部校正集的样品来建模呢?

    4.选定了主成分后,如何进行SIMCA建模?我在下拉菜单中没有找到SIMCA这个选项。

    附件是我将我的数据导入Unscrambler的原始数据。

    第一列为 类别变量:yes表示是我要的品种;no表示不是我要的品种。
    后面的都为进行了预处理的光谱数据。

    看到很多文献上说SIMCA能够实现品种判别,摸索了很久还是不懂,希望某位高手可以看到我的帖子,给我解答。
    希望帖子不要石沉大海才好,希望被专家高手看到呀。。。求人品

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  • 武灵

    第7楼2013/10/09

    附件被验证了我的失误。这个软件我也不会吧。

    另一个自己(v2758843) 发表:非常感谢您的回复。帖子已经好几天了,都没人回。这个问题对我很重要。

    已经把附近的验证了?不怎么懂,求解释哈。。。

    我有这个软件安装包。我 Q272503600 不知您是否有空试试,帮我弄弄。

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  • 另一个自己

    第8楼2013/10/09

    还是没有找到。。。这款软件肯定是具备SIMCA建模功能的,而且是这款软件的重要功能。

    也许您见到这款软件的话,这些问题你一下就可以解决了。不情之请:您如果愿意尝试,您可以加我Q 272503600

    再次真诚感谢您这么详细的回答。祝您 一切顺利

    athosmi(athosmi) 发表:Unscrambler软件的 鉴别模型建立方法都有哪些?我没见过这个软件不太了解如何操作。

    对于lz提的一些问题,我个人的看法:

    1、建模集和检验集的设置,建议使用随机选取设置,这种功能通常软件都有,lz看看软件界面有没有相关的设置。或者在建立模型的时候软件会自动设置检验集(如TQ等软件)

    2、对于yes no或者0 1,对于软件来讲都是一样的,实际上就是分成两类,一类属于中宁枸杞,一类不属于

    3、建模时软件都是会根据设置的建模集样本和检验集样本自动进行建模,建模时只使用建模集光谱集,模型建立好之后自动使用检验集光谱验证模型。不需要想太多。

    4、这就涉及到软件是否具备SIMCA建模功能了。如果没有,你看看软件里是否有主成分鉴别或者类似的鉴别模型方法。SIMCA识别其实和主成分鉴别方法是类似的,只是多了一步剩余信息的统计检验过程。如果没有SIMCA选项就使用主成分鉴别方法配合统计 检验验证,结果基本是一样的。

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  • athosmi

    第9楼2013/10/10

    lz先等我下一个Unscrambler软件看看吧,我刚才看了一下教程感觉好晕呀。你如果需要可以加我的qq,注明一下,不过我平时可能没有上qq的习惯 -_-#,如果不能及时联系,请原谅……

    平时上班我会在这个论坛挂个号,只要不出差都会挂着,在这里找我应该也行……

    另一个自己(v2758843) 发表:还是没有找到。。。这款软件肯定是具备SIMCA建模功能的,而且是这款软件的重要功能。

    也许您见到这款软件的话,这些问题你一下就可以解决了。不情之请:您如果愿意尝试,您可以加我Q 272503600

    再次真诚感谢您这么详细的回答。祝您 一切顺利

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  • athosmi

    第10楼2013/10/10

    哈哈,没弄出来……-_-#
    我的感觉是如果要做定性分类识别模型,需要先进行一个PCA建立一个PCA文件,然后再判别。软件里没有特别的SIMCA方法,个人感觉就是直接使用classify,选择PCA文件就是SIMCA判别了……但是网上评价的PLS-DA是什么东西应该怎么用没思路。
    软件的各种参数设的太诡异了,研究了一中午都没弄出来,lz再找别人问问吧,不好意思。我这几天有时间再研究一下,如果有结果给你发出来。

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