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GCMSsolution 色谱峰定性操作步骤

  • 安平
    2023/08/01
    红小豆
  • 私聊

气质联用(GCMS)

  • GCMSsolution 色谱峰定性操作步骤

    概述



    Shimadzu GCMS使用GCMSsolution工作站进行数据采集和处理,全中文界面,操作较为简易。色谱工作者在获得数据文件之后,如果需要进行色谱峰定性操作,可以参照此文件执行。

    简介



    当以scan方式采集的质谱数据文件已经保存,此时运行GCMSsolution的“GCMS再解析”模块,按照下文步骤执行操作。

    1 打开数据文件

    点击GCMSsolution再解析模块之“助手栏”的“定性”图标,并点击菜单栏中的“文件”-“打开数据文件”,将需要处理的(必须为scan方式采集的)数据文件(后缀为.qgd)打开,如图1所示。

    1 打开数据文件



    此时需要首先设置候选质谱库,点击菜单栏的“定性”项目,选择“定性参数”,如图2所示。

    2 定性参数



    在系统弹出的“定性参数”-“相似度检索”项目中,指定候选质谱库文件,如图3所示。

    参数表列

    最小SI: 系统检索结果中相似度指数(SI)低于此值的结果将不予显示。

    最大命中数:系统检索结果中给出的候选组分个数。

    检索深度: 可以指定重要碎片个数,以提高检索速度。

    反检索: 以质谱图中的质谱图为基准极性质谱检索。可以消除质谱图中噪声和背景干扰影响。

    保留指数允许误差:

    根据数据文件中组分的保留指数与谱库中保留指数偏差,滤除检索结果。

    后检索: 再初步的检索结果中,可以限定索引,缩小命中化合物范围。

    3 相似度检索



    2 获得色谱峰顶质谱图

    以保留时间11.5min的色谱峰为例,在目标色谱峰顶点或者顶点附近双击,获得此时间点的质谱图,如图4所示。

    4 获得色谱峰顶点附近质谱图



    3 执行背景扣除

    点击GCMSsolution再解析图标中的“扣减质谱”图标,如图5所示,在目标色谱峰附近的基线部位双击,系统自动扣除背景获得新质谱图,如图6所示。

    5 扣减质谱

    6 扣减之后的质谱图



    4 检索质谱库

    在质谱图中点击鼠标右键,再弹出菜单中选择“相似度检索”,如图7所示。

    7 相似度检索



    GCMSsolution系统自动返回检索结果,如图8所示。

    8 质谱检索结果



    至此可以获得定性结果。





    背景扣除的方式



    GCMSSolution支持四种背景扣除的方式。

    A点-B点: 上文中操作方式。

    A区间-B点: 首先点击“平均质谱”图标,然后拖动鼠标左键,选中色谱峰内区间,然后点击“扣减质谱”,双击基线某数据点。

    A点-B区间: 首先色谱峰内双击,然后点击“平均和扣减质谱”,选中基线中的某个区间。

    A区间-B区间:首先点击“平均质谱”图标,然后拖动鼠标左键,选中色谱峰内区间,然后点击“平均和扣减质谱”,选中基线中的某个区间。



    小结



    简述GCMSSolution工作站质谱检索的基本步骤。
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  • 不忘初心

    第1楼2023/08/02

    应助达人

    感谢安老师的分享,太实用了,简单易懂。

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  • Ins_7bb0c280

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  • Ins_339bfb4f

    第4楼2023/10/10

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    海大初学者(Ins_7bb0c280) 发表:老师没有谱库怎么操作

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