质谱-质谱的串联方式很多，既有空间串联型，又有时间串联型。 空间串联型又分磁扇型串联，四极杆串联，混合串联等。如果用B表示扇形磁场，E表示扇形电场，Q表示四极杆，TOF表示飞行时间分析器，那么串联质谱主要方式有： ① 空间串联 磁扇型串联方式：BEB EBE BEBE等 四极杆串联：Q-Q-Q 混合型串联：BE-Q Q-TOF EBE-TOF ② 时间串联 离子阱质谱仪 回旋共振质谱仪无论是哪种方式的串联，都必须有碰撞活化室，从第一级MS分离出来的特定离子，经过碰撞活化后，再经过第二级MS进行质量分析，以便取得更多的信息。
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