【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件初步介绍（续）

应助达人

点击Analyze | Analyze GC/MS Data，选Type of analysis为RI Calibration/Performance.



点击Run

应助达人

点击OK，运行后




这样就建立了有关保留指数校正的文件alkanes.csl,alkanes.cal等。


可用记事本检查alkanes保留指数校正文件。例如：


3.845 700.0 100 724 Heptane
4.519 800.0 100 845 Octane
5.849 900.0 100 806 Nonane
11.384 1100.0 100 389 Undecane
15.460 1200.0 100 619 Dodecane
19.784 1300.0 100 627 Tridecane
24.119 1400.0 96 631 Tetradecane
28.345 1500.0 100 649 Pentadecane
32.399 1600.0 100 657 Hexadecane
36.265 1700.0 100 664 Heptadecane
39.851 1800.0 100 410 Octadecane
43.481 1900.0 99 677 Nonadecane
46.883 2000.0 97 702 Eicosane
49.990 2100.0 96 404 Heneicosane
53.209 2200.0 96 705 Docosane
56.079 2300.0 91 424 Tricosane
58.895 2400.0 100 782 Tetracosane

应助达人

保留指数校正的应用


与前面一样调用所要分析的MS数据文件。在Analysis Setting中的Type of analysis


选Use RI Calibration Data及按自己的分析条件修改其它参数。


练习例子：
选择CARP5P.D数据文件打开(Open)：




Analysis----Setting 到Analysis Settings
在Type of analysis选Use RI Calibration Data：

点击Save。
在Analysis菜单下点Analyze GC/MS Data

应助达人

点Run运行。

应助达人

在File菜单下点Go To Results放大结果观察：

注：按Confirm可回到原来的主界面。


化合物ethyl hexadecanoate计算的保留指数(RI)为1991.4，它在MSL目标化合物库的值是1990（此值是在建立MSL库是按化合物的RI值已经输入的），两者相差：1.4。


这样就可以用AMDIS除使用特征离子鉴定目标化合物外，可以结合保留指数校正是鉴定结果更准确。

应助达人

自建库时加入保留指数的方法：


仍以选择CARP5P.D数据文件的ethyl hexadecanote为例。


在library菜单下点Build One Library…


点files


点Create New Library…。并在文件名下输入test.msl，确定（OK）



点Add：[R.I= 1991.4 14.344min CARD5P]（仅仅输入ethyl hexadecanote）或Add All（输入所有化合物）

点New Compound and Specrum


点edit,再点compound


如果有什么编辑或改动，点Save即可。
从上面可以看到ethyl hexadecanote的Index（RI）为1991.4。是由自动计算得到。（注：这里是作为例子，不要和前面的1990相混淆）。用同样的方法可以输入其它化合物的RI值等其它信息。就可以在保留指数校正时应用。

应助达人

从记事本打开结果报告（report）及转换成Excel格式


先生成结果报告（Generate Report），并在Report File下输入保存路径和文件名：



生成报告后，在相应的路径打开此文件。并可转换成Excel文件。便于浏览。包括以下内容：


FileName   
CAS   
Name   
R.T.   
R.I.   
Width   
Purity   
Model   
Min. Abund.   
Amount   
Scan   
Peak Tailing   
S/N (total)   
Base Peak   
Max. Amount   
Area   
Intgr.Signal   
Max. Area   
Expec.
R.T.   
RI-RI(lib)   
Net   
Weighted   
Simple   
Reverse   
Corrections   
S/N (m/z)   
Conc.

应助达人

下面是某白酒样品在PEG-20M色谱柱上的总离子色谱图（一小部分）。 其中乙酸乙酯（4.028分钟）的峰与少量甲醇（4.028分钟）的峰相重叠（后面是乙缩醛，4.254分钟）。直接用PBM检索无法看到甲醇。经过AMDIS处理后，痕量甲醇就能够出现。





Amdis在农残检测，环境，食品安全等领域用处很广，主要是从复杂样品例如食品和环境基质中识别目标化合物，减少假阴性结果等。请参考有关文献。

谱库可不可以拷贝来用呢