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RT-PCR反应过程与体系简历

  • 省部重点实验室
    2012/05/02
  • 私聊

PCR

  • RNA提取


    1.
    200mg组织,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。



    2.
    震荡30s



    3.
    0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min



    4.
    12000
    ×g4 离心,15min



    5.
    吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。



    6.
    加等体积异丙醇,-2030min



    7.
    12000
    ×g4 离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀



    8.
    弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。



    9.
    7500
    ×g4 离心,10min



    10.
    弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥510min



    11.
    沉淀溶于20μl DEPC水,取1μl加入79μl DEPC水测OD260/OD280



    12.
    计算浓度与纯度,-70保存。


           
    OD260
    ×40×稀释倍数



    RNA
    浓度(μg/μl)=────────────




    1000




    +关注 私聊
  • 省部重点实验室

    第1楼2012/05/02

    逆转录合成 cDNA

    反应体系如下

    ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━


    MgCl2
    2μl



    10×RT Buffer
    1μl



    RNase Free dH2O

    3.75μl



    dNTP Mixture(
    10mM)
    1
    μl



    RNase Inhibitor
    0.25μl



    AMV Reverse Transcriptase
    0.5μl



    Random 9 mers

    0.5μl



    Positive Control RNA (1μg)
    1μl


    混匀快速离心一次

    反应条件如下

    30
    10min


    42
    30min


    99
    5min


    5

    5min


    -20 冰箱冻存



    PCR
    反应


    ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━

    摸板cDNA
    2.5
    μl



    5×PCR Buffer
    2.5μl


    灭菌蒸馏水
    7.2
    μl


    聚合酶 Ex Taq HS
    0.1
    μl


    上游引物
    0.1
    μl


    下游引物
    0.1
    μl 


    ─────────────────────────────

     Total
    12.5
    μl


    混匀快速离心一次

    反应条件

    94
    2min
    1Cycle


    94
    40sec



    50
    -65
    40sec

    25-35Cycles


    72
    1min


    72

    5min
    1Cycle



    PCR
    产物-20冰箱保存


    PCR产物8μl 加5×Loading Buffer 2μl 2%琼脂糖凝胶电泳120V


    100mA 30min
    溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果

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