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杂交试验中用于降低背景的封闭剂

  • 省部重点实验室
    2012/11/27
  • 私聊

生命科学仪器综合讨论

  • 杂交试验中用于降低背景的封闭剂

    试剂

    用途



    Denhardt试剂



    Northern杂交



    使用RNA探针的杂交



    单拷贝序列的Southern杂交



    DNA固定于尼龙膜上的杂交



    Denhardt试剂通常配制50×贮存液,过滤后保存于-20℃。可将该贮存液10倍稀释于预杂交液(常为含有0.5%SDS100μg/ml经变性被打断的鲑精DNA6×SSC6×SSPE)中。50×Denhardt液中含5g聚蔗糖(Ficoll,400型,Pharmacia)、5g聚乙烯吡咯烷酮和5g牛血清白蛋白(组分V”Sigmal),加水至终体积为500ml



    BLOTTO



    Grunstein-Hogness杂交



    Benton-Davis杂交



    除单拷贝序列Southern杂交以外的所有Southern杂交



    斑点印迹



    1×BLOTT(牛乳转移技术优化液,Bovine Lacto Transfer Technique Optimizer,是含5%胶脂奶粉和0.02%叠氮钠的水溶液,应保存于4℃。使用前可用预杂交液稀释25倍。BLOTTO不应与高浓度的SDS并用,因为后者会导致牛奶中蛋白质析出。如果杂交背景不合要求,可在杂交液中加入NP-40至终浓度为1%BLOTTO不能用作Northern杂交的封闭剂,因为这一封闭剂中可能含有RNA酶,其活性之高使人无法接受。



    注意:叠氮钠有毒性,取用时需戴手套小心操作。含叠氮钠的溶液应予明确标记。



    肝素



    Southern杂交



    原位杂交



    肝素(Sigma H-7005,从猪中提取的二级产品或相当等级的产品)用4×SSPE4×SSC溶解配制成50mg/ml的浓度,保存于4℃。肝素在含有葡聚糖硫酸酯的杂交液中用作封闭剂的浓度为500μg/ml,在不含葡聚糖硫酸酯的杂交液中的浓度为50μg/ml



    经变性并被打断的鲑精DNA



    southernNorthern杂交



    把鲑鱼精子DNASigma,Ⅲ,盐钠)溶解于水配制成10mg/ml的浓度,必要时于室温磁力搅拌24h助溶。把溶液中NaCl的浓度调至0.1mol/L,并用酚和酚/氯仿各抽提一次,回收水相。合DNA溶液快速通17号皮下注射针头12次,以剪切DNA。加入2倍体积用冰预冷的乙醇沉淀DNA。离心回收DNA并重溶于水,配制成10mg/ml的浓度,测定溶液的OD260值并计算出精确的DNA浓度,然后煮沸10min,分装成小份保存于-20℃。使用前置沸水浴中加热5min,然后迅速在冰浴中骤冷。预杂交液中应含有100μg/ml经变性并被打断的鲑鱼精子DNA

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