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MassHunter的未知物分析和Amdis—解卷积效果对比

  • symmacros
    2020/09/08
    Science
  • 私聊

气质联用(GCMS)

  • MassHunter的未知物分析和Amdis—解卷积效果对比



    从上篇“应用MassHunter的未知物分析处理香气样品数据”可以看出未知物分析软件解卷积功能非常不错,能够逐一拆分共流出峰。下面和优秀的Amdis解卷积全自动质谱数据处理软件进行对比。

    首先amdis全自动检索运行需要自己独特的数据库,而未知物分析软件不需要特殊的数据库。另外Amdis解卷积后进行自动检索只能使用一个自己独特格式的数据库,而未知物分析可以使用多个安捷伦格式的谱库。

    下面通过样品来进行解卷积效果对比。



    图1 样品总离子色谱图TIC



    Amdis在分辨率和灵敏度为“中”的情况下,找出487个化合物,268个target目标物(谱库化合物数量相同相当)。



    图2 Amdis检索参数



    而未知物分析软件找出1114个组分,231匹配。可以看出来未知物分析软件的解卷积功能很强,逐一拆分后进行检索,并且不需要解卷积数据库。未知物分析的匹配数量231比Amdis 的268目标化合物少了一些,这是因为未知物分析只是对匹配度80以上的组分(方法设定)列出来。而Amdis的最小匹配度为40。如果Amdis的最小匹配度设置为80,则找出487个化合物,94个target目标物。少于未知物分析的化合物数量和目标化合物数量。下面仍以Amdisde 最小匹配度为40进行对比。



    图3 Amdis检索(最小匹配度40)





    图4 Amdis检索(最小匹配度80)



    在未知物分析上面,10.9796匹配不理想m/z110和91离子差别明显,可以删掉



    例一,10.978在工作站TIC似乎是一个峰



    在未知物分析解卷积后为三个组分。





    在amdis拆分到两个组分,比未知物分析少一个组分。



    在amdis上面是两个化合物Cyclotetrasiloxane, octamethyl-和5-Hepten-2-one, 6-methyl-。

    例二,在15.688min在工作站上面也是一个峰。点击峰不同位置也难以检索得到不同的化合物。



    在未知物分析上面拆分为两个峰。



    Amdis仅仅一个化合物,没有拆分成功。

    例三,24.269min



    在未知物分析上面拆分为24.2404和24.2686两个组分。



    在Amdis上面也拆分为两个组分。



    例四,24.955分钟



    未知物分析为24.9537和24.9661两个,Amdis一个。

    其它例子,31.404拆分为两个,Amdis一个。

    31.593分钟未知物分析和Amdis都是两个组分。

    33.616分钟未知物分析和Amdis都是两个组分

    小结:

    未知物分析软件解卷积功能非常不错,能够逐一拆分共流出峰,可以和Amdis相媲美,或者某些地方更胜一筹。两个都是很好的解卷积软件。

    Amdis全自动检索运行需要自己独特的数据库,而未知物分析软件不需要特殊的数据库。

    Amdis解卷积后进行自动检索只能使用一个自己独特格式的数据库,而未知物分析可以使用多个安捷伦格式的谱库进行顺序检索。

    以上对比仅仅局限于本次两个软件的参数设置的情况,不能全部进行完全的比较。可能有许多不足不妥之处,敬请谅解和批评指正
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  • symmacros

    第1楼2020/09/08

    应助达人

    欢迎拍砖批评指正!

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  • GRANT

    第2楼2020/10/10

    应助达人

    挺好的一篇解卷积知识介绍!
    请问下,两者解卷积功能差不多,是针对定性的,那么定量方面的比较,好像没讲到,有空也请讲讲哈

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  • symmacros

    第3楼2020/10/19

    应助达人

    谢谢。定量没有讲的,回头有时间比较一下定量来分享一下。

    GRANT(fatinsect) 发表:挺好的一篇解卷积知识介绍!
    请问下,两者解卷积功能差不多,是针对定性的,那么定量方面的比较,好像没讲到,有空也请讲讲哈

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  • Ins_c7f58b1e

    第4楼2021/05/26

    请问代谢组做解卷积用masshunter,最后归一化时要用解卷积峰面积还是组分峰面积呢?

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