MassHunter的未知物分析和Amdis—解卷积效果对比
从上篇“应用MassHunter的未知物分析处理香气样品数据”可以看出未知物分析软件解卷积功能非常不错，能够逐一拆分共流出峰。下面和优秀的Amdis解卷积全自动质谱数据处理软件进行对比。
首先amdis全自动检索运行需要自己独特的数据库，而未知物分析软件不需要特殊的数据库。另外Amdis解卷积后进行自动检索只能使用一个自己独特格式的数据库，而未知物分析可以使用多个安捷伦格式的谱库。
下面通过样品来进行解卷积效果对比。
图1 样品总离子色谱图TIC
Amdis在分辨率和灵敏度为“中”的情况下，找出487个化合物，268个target目标物（谱库化合物数量相同相当）。
图2 Amdis检索参数
而未知物分析软件找出1114个组分，231匹配。可以看出来未知物分析软件的解卷积功能很强，逐一拆分后进行检索，并且不需要解卷积数据库。未知物分析的匹配数量231比Amdis 的268目标化合物少了一些，这是因为未知物分析只是对匹配度80以上的组分（方法设定）列出来。而Amdis的最小匹配度为40。如果Amdis的最小匹配度设置为80，则找出487个化合物，94个target目标物。少于未知物分析的化合物数量和目标化合物数量。下面仍以Amdisde 最小匹配度为40进行对比。
图3 Amdis检索（最小匹配度40）
图4 Amdis检索（最小匹配度80）
在未知物分析上面，10.9796匹配不理想m/z110和91离子差别明显，可以删掉
例一，10.978在工作站TIC似乎是一个峰
在未知物分析解卷积后为三个组分。
在amdis拆分到两个组分，比未知物分析少一个组分。
在amdis上面是两个化合物Cyclotetrasiloxane, octamethyl-和5-Hepten-2-one, 6-methyl-。
例二，在15.688min在工作站上面也是一个峰。点击峰不同位置也难以检索得到不同的化合物。
在未知物分析上面拆分为两个峰。
Amdis仅仅一个化合物，没有拆分成功。
例三，24.269min
在未知物分析上面拆分为24.2404和24.2686两个组分。
在Amdis上面也拆分为两个组分。
例四，24.955分钟
未知物分析为24.9537和24.9661两个，Amdis一个。
其它例子，31.404拆分为两个，Amdis一个。
31.593分钟未知物分析和Amdis都是两个组分。
33.616分钟未知物分析和Amdis都是两个组分
小结：
未知物分析软件解卷积功能非常不错，能够逐一拆分共流出峰，可以和Amdis相媲美，或者某些地方更胜一筹。两个都是很好的解卷积软件。
Amdis全自动检索运行需要自己独特的数据库，而未知物分析软件不需要特殊的数据库。
Amdis解卷积后进行自动检索只能使用一个自己独特格式的数据库，而未知物分析可以使用多个安捷伦格式的谱库进行顺序检索。
以上对比仅仅局限于本次两个软件的参数设置的情况，不能全部进行完全的比较。可能有许多不足不妥之处，敬请谅解和批评指正
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