四气理论的蛋白质组学研究四气最早指代四时之温、热、冷、寒的气候变化，在“天人相应”哲学观念及阴阳学说的影响下《神农本草经》中首次提到：“药有寒、热、温、凉四气”，将“四气”明确为药性的概念。随着后世诸多本草名著的沿用并不断完善和发展，对四气的认识得到了进一步的深化。到了宋代，为了区别于气息之“气”，寇宗奭的《本草衍义》提出：“凡称气者，即是香、臭之气，其寒、热、温、凉则是药之性。”改气为性这一论点被后世医家所采纳。无论称之为“气”还是“性”，皆指药物所具有的内在特性，也是对药物功能的概括。因此《神农本草经百种录》中有云：“入腹则知其性”。不同的性表达出不同的功能，李东垣在《医学发明》云：“热病以寒治，寒病以热治。”由此可见药物四性的确立与运用是药物对机体的作用所引起的反应的总括，主要是相对于所治疗的疾病的寒热性质而言，反映了中药对人体阴阳盛衰、寒热变化的作用倾向[18]。中药是一个复杂的化学成分体系，药理作用广泛且繁杂。因此，要深入理解和阐释中药四气的科学内涵，需要超越传统研究方法，将物质基础与药理作用综合起来进行全面系统的研究。王厚伟等[19]采用全电性离子色谱法分别获得温热中药（仙茅、干姜、肉桂）和寒凉中药（金银花、黄连、知母）的蛋白色谱峰，并甄选出相同药性中药的共有药性标识峰，为检测中药的药性物质基础提供了新思路。李毅等[20]则运用双向凝胶电泳（two-dimensional gel electrophoresis，2-DE）和质谱技术，探究了温热中药对于寒证模型大鼠的肝线粒体蛋白组影响。研究发现，温热中药主要通过增强糖、脂质代谢和蛋白质的合成来提高能量代谢活跃，改善寒证症状。李晶等[21]采用蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction，PPI）网络分析具有活血化瘀功效的温苦肝中药姜黄和延胡索、寒苦肝中药赤芍和丹参的主要活性成分和靶点，结果表明温性、寒性蛋白网络通过不同的靶点共同参与调节血液循环、脂质代谢等生命活动，从分子网络水平阐释了寒热药性的具体特性。王秋红等[22]运用二维液相色谱串联质谱技术（two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry，2D-LC-MS/MS）探究辛热中药附子、干姜、花椒对正常大鼠能量代谢和相关蛋白表达有影响。结果表明附子、干姜、花椒等中药通过增加体内热量生成和提高对能量的利用来影响机体的能量代谢。这些研究结果诠释了药性与功效的内在联系，为中药性味理论提供了科学依据
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