AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用 (5)-数据处理的一些问题探讨

应助达人

(5)-数据处理的一些问题探讨

1． 一个化合物多次在Amdis里面出现的含量问题
1.1 下面是某一样品的总离子色谱图，其中乙酸异丁酯isobutyl acetate如下图。

图 3 乙酸异丁酯TIC
而运行Amdis时候会出现两次结果，分别是5.1786min和5.1859min。


图4 乙酸异丁酯Amdis结果

图5乙酸异丁酯Amdis结果
5.1786min的含量Amount=0.0245%，解卷积后的纯度，检索正反匹配度和权重都很高99, 97, 99, 98。
5.1859min的含量Amount=0.0151%，解卷积后的纯度，检索正反匹配度和权重都很高99，97, 99, 98。
在这种情况下，乙酸异丁酯总含量（最终含量）应该是0.0245+0.0151=0.0396%。
当然也可以把其峰面积相加来进行有关计算。
在TIC上面提取主要离子m/z 43,56,73也看到是完整的色谱峰。只是Amdis判断成了两个峰罢了，所以要相加含量即可。

图6乙酸异丁酯离子提取图
1.2在看看ethyl butyrate也是被认成两个峰（点）。

图7 ethylbutyrate的Amdis结果
5.6810min: Amount=0.0400%, 5.6832min: Amount=0.0445%, 检索匹配度也都很高。即ethyl butyrate的含量为0.0845%。
1.3 ethyl 2-methylbutyrate在多个地方出现，也是用同样的方法来加和处理。

图8 ethyl2-methylbutyrate的Amdis结果
可以看到在5.9908,5.9959，6.0222,6.0353，6.0382min出来5个结果。
另外也可以通过调整Amdis的设定参数（例如灵敏度，阈值等）来减少重复出现的结果。不过有时候难免有重复结果的出现，且不同扫描段的最佳解卷积参数也不一样，要想每个峰都不出现重复结果的理想状态是比较难的。

应助达人

2 共流峰的含量分配
下面是roseoxide和2-methyl-4-isopropyl-2-thiazole的合峰。

图9 roseoxide和2-methyl-4-isopropyl-2-thiazole的合峰Amdis结果
可能看到，16.125min:roseoxide(0.023%), 16.1254min匹配度不高，舍去，16.1276min: roseoxide(0.061%)和16.1538min: 2-methyl-4-isopropyl-2-thiazole(0.00123%)。即Roseoxide: 0.084%, 2-methyl-4-isopropyl-2-thiazole: 0.00123%。比例大致68.3:1。Rose Oxide的提取离子m/z 139, 69, 154和2-methyl-4-isopropyl-2-thiazole提取离子m/z 126, 72, 141图如下。

图10 roseoxide和2-methyl-4-isopropyl-2-thiazole的提取离子结果
更多例子请参考我以前的帖子。

朱老师又发表新作了，收藏起来学习。

应助达人

以前有网友问这个问题，当时只是简单回答了一下，今天整理一下和大家分享。

应助达人

这个一定要收藏的,对我们做香精分析的特别有用啊

朱老师系列作品必须关注。我想问下AMDIS的amount%是怎样计算的？和chemstation的百分含量相差的比较多。

应助达人

AMDIS的amount%也是对解卷积后提纯的化合物离子进行积分后归一化法进行计算。但和ChemStation的计量计数方式不同。但在一定范围内是有比例关系。

一个峰有多个相同结果出来比较烦，要相加一下。

应助达人

香精分析amdis还是个不错的工具，多探讨交流。