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【仪器心得】关于在安捷伦软件建立或编辑谱库

  • 四棵树
    2023/09/01
    状元秀
  • 私聊

气质联用(GCMS)

  • 【仪器心得】关于在安捷伦软件建立或编辑谱库



    在GC -MS中,对某个未知化合物定性,我们经常使用NIST库或Wiley库进行检索,然而也会遇到库里没有的,我们可以将库里没有的化合物添加进去,完善自己的谱库。或者对于香精香料公司,想要自己公司的一个谱库,这时就可以建立一个专属香精香料谱库,排除一些不需要的检索结果。

    一、在MSD ChemStation和MassHunter Qualitative Analysis的谱库编辑器建立谱库:

    1.安捷伦经典 (MSD ChemStation) 软件(增强型数据分析)建立谱库:

    打开安捷伦MSD ChemStation增强型数据分析软件,然后点窗口第一行菜单栏的“质谱图”,选择“编辑谱库”会弹出下面的窗口,要是想新建谱库可以选择“创建谱库”,命名新谱库,要是想在原有谱库或者新谱库添加新的化合物,就要点“选择谱库”,选中你想添加的谱库,然后在TIC图选中目标峰,再点编辑谱库的“添加新条目”,如下图,填好信息确定后完成。




    要是填错信息可以选择“编辑现有条目”(记录好该化合物条目号,例如我们库里cis-6-Nonenol是589),输入要编辑条目号,确定。分子量和分子式是改不了的,要是不想要这个条目,就取消勾选检索过程中有效。



    2.在安捷伦自带的谱库编辑器中建立谱库,这个适用于安捷伦新版分析软件MassHunter Qualitative Analysis中使用:



    打开谱库编辑器,点“文件”中“新建”,命名号新谱库名字,保存。选择新建化合物,输入要添加的化合物信息,例如cis-6-Nonenol。然后在MassHunter Qualitative Analysis中打开进样的化合物,选择需要添加的峰,复制其质谱图,粘贴到谱库中去。如下图:





    还有个分子式文件,可以到https://www.chemspider.com/Default.aspx中输入该化合物CAS号,查找其化合物结构图。按保存,下载结构图,然后回到谱库选择分子式文件那三个点,点“出自文件”,选择刚刚保存好的文件打开,确定就可以啦。或者下载chemdraw这类软件、在里边画好后,是一个mol格式的文件,在谱库里导入进去就行了。



    二、实现将在MassHunter Qualitative Analysis的谱库编辑器建立的谱库转换到MSD ChemStation中使用:

    上面的两种方法建立的谱库,安捷伦经典 (MSD ChemStation) 软件的新建谱库可以在“谱库编辑器”中打开,看到其总化合物列表,可“谱库编辑器”中建立的谱库我试过不能在安捷伦经典软件(MSD ChemStation) 中直接使用,还要经过转换。下列介绍转换方法:

    1.打开“谱库编辑器”的新建谱库,选择所有的行,在文件菜单下“导出JCAMP文件”,输入要导出的文件名;

    2.在安捷伦经典软件(MSD ChemStation) 点菜单栏的“视图”下的“参数检索”,选择取消;

    3.在上一步的界面菜单栏的“谱库”选择“读取JCAMP文件”,选择刚刚导出的文件,输入新的文件名,等读取完毕后确认;

    4.点菜单栏的“视图”,返回到数据分析,最后可以选择刚刚读取得谱库进行检索啦。

    对于这两种分析软件比较习惯用比较旧的安捷伦经典软件(MSD ChemStation)使用分析,不过个人觉得“谱库编辑器”确实挺好用的,能看到总谱库的建立情况,可以很直观的看到你想搜索的化合物的一个信息和其质谱图,还可以进行修改和删除。而在安捷伦经典软件(MSD ChemStation)就看不到新建谱库的总体情况和质谱图,而且其写错的化学式和质量并不能修该,只能通过“编辑现有条目”里取消检索过程中有效,并不能直接删除该化合物。还有一个重要的点就是建立的谱库里化合物最好是以英文记录,要是使用中文的话,在“谱库编辑器”打开MSD ChemStation中建立的新谱库或者在MSD ChemStation打开已读取转换“谱库编辑器”里新谱库的信息的时候,中文都会出现乱字符,所以最好就是使用英文化合物名称。
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  • fjj1989

    第1楼2023/09/04

    应助达人

    学习了,确实香精香料行业少不了要自己建库。

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  • 不想做小白菜

    第2楼2023/09/07

    感谢分享!

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  • 状元秀

    第3楼2023/09/22

    应助达人

    很具有创意性的一篇文章。

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  • alva he

    第4楼2023/09/28

    厉害,学习到了。

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  • symmacros

    第5楼2023/10/14

    应助达人

    谱库编辑器确实要方便一些。

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