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【金秋计划】归脾汤治疗抑郁症和胃肠道疾病的机制和分子靶点
城头变幻大王骑
2024/09/05
私聊
中药/天然药检测
归脾汤
(G
P
D)
源自宋朝严氏《济生方》,主要用于治疗
心脾两虚
,经后世医生的临床实践,其应用范围得到了拓展,不仅能
改善胃肠
(GI)功能
,还能
改善抑郁情绪
。
该研究用党参代替人参,在原方的基础上加入玫瑰以益气解郁,并将所有药物联合使用,达到健脾宁心、养血安神的效果。这项
生物信息学
研究旨在揭示
抑郁症和胃肠道疾病之间潜在的串扰基因和相关途径
。采用
网络药理学方法
探讨GPD同时治疗抑郁共病胃肠道疾病的分子机制和潜在靶点。
基于GSE98793和GSE19738基因对重度抑郁症(MDD)差异表达基因(DEGs)进行鉴定,并从GeneCards数据库中筛选GI疾病相关基因。获得
MDD和GI疾病之间的重叠基因,以鉴定潜在的串扰基因
。构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络筛选枢纽基因,LASSO回归分析鉴定特征基因,单样本基因集富集分析(ssGSEA)分析
免疫
细胞浸润。
此外,基于中药系统药理学(TCMSP)数据库,筛选GPD的有效成分和靶点,分别确定GPD与MDD和GI疾病相关基因的交叉靶点。
利用Cytoscape构建了一个“组件-目标”网络,并对基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路进行了分析。
MDD校
正后的数据集包含2619个DEG,共获得
109个串扰基因
。
筛选
14个枢纽基因,分别为
SOX2、CRP、ACE、LEP、SHH、CDH2、CD34、TNF、EGF、BDNF、FN1、IL10、PPARG、KIT
。
这些基因通过LASSO回归分析鉴定了3个特征基因,包括TNF、EGF和IL10。
Gamma.delta.T.cell与这三个特征基因均呈显著正相关,而Central.memory.CD4.T.细胞和Central.memory.CD8.T.细胞与EGF和TNF呈显著负相关。
GPD含有134种有效成分和248个靶点,其中治疗抑郁症和胃肠道疾病的相关靶点分别为41个和87个。EGF、PPARG、IL10和CRP与该疾病的中枢基因重叠。
结论
该研究发现
GPD可能通过EGF、PPARG、IL10和CRP靶点调控炎症和氧化应激反应,进而参与抑郁症和GI疾病的治疗
。
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