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AMDIS初步应用 (11) –部分常见问题讨论小汇集（2）

symmacros

2017/06/27

气质联用（GCMS）

AMDIS初步应用 (11) -部分常见问题讨论小汇集（2）
1、在学习AMDIS操作的时候，在调用自己文件，选用Mode——Component时，这个按钮是灰色的，为何？而且我有点不大明白，target和Component这两个有什么区别呢？在具体操作的时候应该注意些啥？见图1
（网友提供的图无法打开）
解答（仅供参考，下同）：
在未进行运行run之前Mode菜单下面的按钮Target only, component等都是灰色的。等你点击target only之后就是target状态，在右边的中上部位置目标离子轮廓图右边的结果result区域就能看到Amdis自动检索的结果。如下图：

这时候target only按钮就是灰色，component是亮的。按component，就切换到component模式，在结果框内显示该峰（点）解卷积的信息，但没有Amdis检索的的结果。在component模式下还可以自建Amdis谱库。如下图：

还可以在T（target）和倒三角▽（component）点击来切换观察。

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2、在打开自己文件后，有很多个峰，如何定位到每一个单独的峰上，是放大？还是点击峰顶部？

解答：
可以放大后观察，可以找峰（点）的保留时间来看结果。注意，放大后观察还能提高检索人别率，对得到的结果有好处。也可以点击TIC图上面的符合T或倒三角▽来观察这个峰。
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3、AMDIS如何自动积分？在哪一个部分的功能？如何操作？
解答：
在Analysis Setingsde Deconv的sensitivity，Resolution等参数的改变来影响解卷积的结果和单个区域峰的积分结果。可以定量，有峰面积和相对含量，有报告。用Amdis结果中峰面积（area%）或含量（amount%）来帮助定量，但需要筛选和甄别含量结果，剔除不必要的结果，合并重复的结果等而得到更为合理的结果。

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4、在自建库章节，讲到了讲NIST谱库的标准物质添加到自建库当中，可是在转化好 msp文件并保存到桌面后，Library transfer却无法选择这个区域的文件，我把他存在此文件按装的默认文件夹下，仍是无法识别，为何？另外，将转化到自建库文件夹当中时，是重新起个名字还是直接保存到之前建的自建库名字下，会不会把之前的文件覆盖掉？

点击xxx（必须点击变实），按Transfer>， Exit。这样就在MMM.MSL里面成功添加了己醛的谱库。
将转化到自建库文件夹当中时，如果你认为有更合适的名字或更好的名字，就可以重新起个名字，直接保存到之前建的自建库名字下，就是把这个化合物的谱图加入到这个谱库里面了。
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5、在AMDIS的匹配结果中，有Net=86,weight=85, simple=63, reverse=90（一个随机的例子，与问题无关），这些匹配的结果，应该先看什么，再权衡什么，舍弃的标准是什么？
解答：
首先看Reverse，并看一下Amdis界面第四个区域，是数据谱库和提取色谱图的比较。其中黑色为标准谱库里的质谱图，白色为经解卷积处理后提取的“干净”的质谱图。黑白的质谱图重叠程度越高，代表这个峰纯度越高。Reverse是反向匹配，反映解卷积后的峰的匹配情况，越高越好，一般90以上。Simple是正向匹配，受其它干扰离子或其它混在一起的其它化合物离子的影响。Weight权重，net净值等可以参考一下。
如果几种值都很高，并且接近，一般讲是峰的纯度非常好。
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分
该帖子已被版主-有雨的夜加10积分，加2经验;加分理由:原创

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Kevin

第1楼2017/06/27

又见朱老师大作，赞

0

百万个为什么

第2楼2017/06/27

拜读朱老师大作！

0

wazcq

第3楼2017/06/27

应助达人

Simple是正向匹配，受其它干扰离子或其它混在一起的其它化合物离子的影响。那是解卷积后的匹配吧？
Weight权重解释能具体些吗

0

sallysally

第4楼2017/06/27

simple，reverse, net值有时候很接近。

0

symmacros

第5楼2017/06/27

应助达人

原创大赛预热一下。
Kevin(m3163882) 发表:又见朱老师大作，赞

0

bfm00

第6楼2017/06/27

朱老师又有新作了。

0

symmacros

第7楼2017/06/27

应助达人

simple是谱库的简单点积和解卷积后包含所有离子峰的成分比较。
weight是谱库的标尺点积和解卷积后使用最佳权重程度成分比较。
这些和计算机算法有关，是不同的算法。
wazcq(wazcq) 发表:Simple是正向匹配，受其它干扰离子或其它混在一起的其它化合物离子的影响。那是解卷积后的匹配吧？
Weight权重解释能具体些吗

0

symmacros

第8楼2017/06/27

应助达人

如果几种值都很高，并且接近，一般讲是峰的纯度非常好。
sallysally(sallysally) 发表:simple，reverse, net值有时候很接近。

0

Kevin

第9楼2017/06/28

symmacros(jimzhu) 发表: 原创大赛预热一下。

0

GRANT

第10楼2017/06/28

应助达人

好文章，温故而知新

0

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