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SCIEX QTRAP 5500 Glu-Fibrinopeptide B 调源标准操作规程

  • zhangyongmei
    2024/10/03
  • 私聊

液质联用(LCMS)

  • 1.目的

    保证在QTRAP5500 nano源下,用注射器进行正确的调源

    2.责任

    设备负责人应根据维护计划定期对QTRAP5500进行离子阱质量校正;

    所有操作人员必须严格按照本操作规程所规定操作;

    3.实验原理

    特征峰的强度表征仪器的灵敏度。




    4.操作步骤




    4.1 Q1(推荐的调源方式)

    4.1.1进入Analyst软件界面,双击Manual Tuning

    4.1.2打开调源的文件,进Glu-Fibrinopeptide B的终溶液(浓度50fmol/μl),选择 ,勾上use(),设置,选择流速为300nl/min(500nl/min);

    4.1.3改变喷针的位置优化信号强度,注意喷雾不要太靠近orifice,改变heated interface的温度,优化信号和降低背景噪音,另外,可以调整CUR、IS和GS1;

    4.1.4一旦出现了稳定的喷雾,进行Q1扫描5分钟,同时观测喷雾的稳定性,良好的状态是:在TIC窗口中起伏很小,并且噪音峰也是很低、很短暂的;

    4.1.5接着,用MCA方式采集10个Cycles,保存数据:Sample Name: Q1 scan ,Data File: QTRAP system Nanospray Test

    4.1.6打开数据文件,放大m/z为786的峰(View -> Graph Info Window), 看intensity是否达到3e6;达到后则记下喷雾与源气参数,此时的灵敏度为最优。

    4.2 EMS(紧接Q1)

    4.2.1打开调源的文件,切换到EMS扫描模式,按表1,设置一些参数,其它值先按经验值设置;

    4.2.2调整源气参数或源的位置,按表2看主要的特征峰是否出现,一旦喷雾稳定,保存数据:Sample Name: EMS scan ,Data File: QTRAP system Nanospray Test

    1


    Tab

    Parameter

    Setting



    MS


    Scan type


    Enhanced MS(EMS)


    Polarity


    Positive


    MCA


    Select checkbox


    Start(amu)/Stop(amu)


    400.000/1000.000


    Optimize Masses


    Click button


    Number of scans to sum


    1


    Cycles


    10


    Advanced MS


    Scan rate(Da/s)


    10,000


    Fixed LIT fill time(ms)


    0.5ms


    Q0 Trapping


    Deselect checkbox

    2


    M+nH)n+ monoisotopic m/z for charge of Glu-Fibrinopeptide B



    +1


    +2


    +3


    +4


    +5


    +6


    1570.6768


    785.8421


    524.2305


    393.4247






    4.2.3 m/z为786的峰,intensity需达到3e6。

    4.3 EPI

    4.3.1 打开调源的文件,按表3,设置一些参数,其它值先按经验值设置;







    3


    Tab

    Parameter

    Setting



    Resolution


    Q1 Resolution


    Unit


    MS


    Scan type


    EPI




    Polarity


    Positive




    Product Of(amu)


    785.9




    MCA


    Select checkbox




    Start(amu)/Stop(amu)


    100.000/280.000

    275.000/1000.000




    Optimize Masses


    Click button




    Number of scans to sum


    1




    Cycles


    10


    Advanced MS


    Scan rate(Da/s)


    20,000




    Fixed LIT fill time(ms)


    10




    Q0 Trapping


    Off


    4.3.2按表4看主要的特征峰是否出现;

    4 Theoretical fragment ions of Glu-Fibrinopeptide B


    b ions

    y ions

    (m/z)

    Fragment

    (m/z)

    Fragment

    1570.6768

    EGVNDNEEGFFSAR

    130.0499

    E

    1441.6342

    GVNDNEEGFFSAR

    187.0713

    EG

    1384.6128

    VNDNEEGFFSAR

    286.1397

    EGV

    1285.5444

    NDNEEGFFSAR

    400.1827

    EGVN

    1171.5014

    DNEEGFFSAR

    515.2096

    EGVND

    1056.4745

    NEEGFFSAR

    629.2525

    EGVNDN

    942.4316

    EEGFFSAR

    758.2951

    EGVNDNE

    813.3890

    EGFFSAR

    887.3377

    EGVNDNEE

    684.3464

    GFFSAR

    944.3592

    EGVNDNEEG

    627.3249

    FFSAR

    1091.4276

    EGVNDNEEGF

    480.2565

    FSAR

    1238.4960

    EGVNDNEEGFF

    333.1881

    SAR

    1325.5281

    EGVNDNEEGFFS

    246.1561

    AR

    1396.5652

    EGVNDNEEGFFSA

    175.1190

    R

    1552.6663

    EGVNDNEEGFFSAR



    4.3.3按表5看主要的特征峰(不需要全部的峰都出现)的Intensity是否接近或达到说明书的示范图的指标;

    5


    m/z

    246.156

    333.188

    480.257

    627.325

    684.346

    813.389

    942.432

    Intensity

    7e5

    4.1e6

    4.0e6

    1.5e6

    7.0e6

    4.0e6

    2.5e6



    4.3.4调源完成后,保存数据,不保存方法。

    5.质量标准与评估

    质量指标名称

    质量指标

    测量方法



    m/z为786的intensity


    ≥3e6


    Q1 scan


    m/z为785.8的intensity


    ≥3e6


    EMS scan




    6.参考文献


    AB SCIEX QTRAP 5500 System Installation Guide

    7.注意事项

    7.1
    如果特征峰的intensity太低,用Q1扫描模式调整nano源的条件保证达到最佳的位置、针尖突出长度以及源气参数;

    7.2如果S/N太低,调整源的条件保证达到最佳的位置、针尖突出长度以及源气参数,若注射器注射过其他样品,应在实验前用新的样品清洗一下注射器。

    7.3调源时须注意带乳胶手套,以免高压触电;

    7.4仪器正常运行时,禁止接触离子源和打开离子源盖,避免受到高温、高压和激光伤害;

    7.5仪器停止工作后半小时内,禁止接触离子源,避免受到高温的伤害;

    8.附录

    附录A:实验仪器设备

    附录B:实验试剂和耗材

    C:试剂配制方法

    附录D:修订记录

    附录A实验仪器设备

    仪器名称

    型号

    厂家



    QTRAP5500


    QTRAP5500


    AB SCIEX




    附录B实验试剂和耗材

    试剂


    试剂名称

    型号

    厂家



    乙腈


    HPLC 4L


    Fisher Chemical


    纯水




    millpore


    甲酸


    HPLC 50ml


    迪马


    Glu-Fibrinopeptide B


    100μg


    AB SCIEX


    耗材



    耗材名称

    型号

    厂家



    离心管


    1.5ml


    爱思进


    枪头


    10μl、200μl、1000μl


    爱思进


    注射器


    一体100μl,内径1.46mm


    迪马








    附录C 试剂配制方法

    1.1储液
    100μg Glu-Fibrinopeptide B的瓶内加入600μl×2(共1200μl)的标准稀释液(0.1% 甲酸,30%乙腈),浓度为50pmol/μl,涡旋震荡至少2min,稍微离心使液体至管底,分装后,-20℃保存;

    1.2终溶液:1μl的储液用0.1%FA稀释成1000μl,即终浓度为50fmol/μl,涡旋震荡至少30s,离心至少10s使液体至管底,4℃使用,使用时间为3天
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