AMDIS初步应用 (19) –如何利用Nist Search的结果弥补数据库局限性

AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用 (19)

–如何利用Nist Search的结果弥补数据库局限性

图1 解卷积过程的简单示意图

(19) –如何利用Nist Search检索结果

图 2 单个化合物Amdis到NIST Search

图3 NIST Search检索结果

图 4 多个化合物Amdis到NIST Search

图5 多个化合物NIST Search检索结果

可以看到在NIST Search有3个传送过来的质谱数据。其中第三个（2.581min）检索结果是Ethyl acetate，而在Amdis的结果里面是??n-Propyl acetate，匹配度不高，Weighed仅为60。这是因为Amdis所选的谱库（Amdis本身所带的NISTFF.MSL）不够好而引起的。而NIST Search的结果更为准确，可以补充弥补数据库有限化合物的不足之处。

3. 在Amdis检索结果里面直接得到所以峰/化合物的NIST Search结果

在Amdis的Analysis菜单点击Search NIST Library…

图6 Amdis到NIST Search

看到Search NIST Library的参数对话框，如下图。

图7 Search NIST Library参数和NIST Search检索库选择

Hit reported per search下面Max # hits可以选择最多的匹配数；Min match factor可以选择最低的匹配度；probability选匹配概率。

Use instrument m/z limits打勾；Build combined result打勾。

Select from下面选All components(n)。

Number of components searched：Largest components：选最多需要检索的化合物个数；或者选All above threshold选择过滤的阈值。

NIST MS directory选择NIST Search的文件路径。

Libraries：选择使用的NIST Search检索的数据库，可以单个或多个数据库。

然后Select回到上一级对话框，点击Analyze运行NIST Search程序。

图8 运行NIST Search程序

重新对话框，选择Keep，保留Amdis结果。

图9 Amdis结果保留

这样在Amdis检索结果里面就有NIST Search检索的结果了。

图10 显示不同检索结果

在Amdis的View菜单下面可以选择Show NIST Search(NIST Search检索结果)或Show Amdis Search(Amdis检索结果)或Show Merged Result（两者合并结果）。

图11 合并结果

上图为Amdis检索和NIST Search检索的合并结果，可以看到2.5814有两个结果，??n-Propyl acetate和>Ethyl Acetate。这样可以通过对比匹配度和谱图对比来选用合适的结果。例如Ethyl Acetate的weighted是95，而??n-Propyl acetate的weighted仅为60，就不对了。

这样就可以在AMDIS上面利用NIST Search全检索结果了，弥补AMDIS库谱不够的问题了。对于没有AMDIS数据库或者数据库化合物条目有限的朋友是一个参考。

AMDIS结果和NIST Search结果内容有所区别，前者内容多一些，后者少一些（化合物名称前面<）。这是因为两者来自不同的检索方式和不同的结果表达，并不影响结果。

图12 AMDIS结果

图13 NIST Search结果

全文完